More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1498 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1744  Rieske (2Fe-2S) region  89.63 
 
 
376 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  784    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1035  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.8 
 
 
379 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0953  Rieske (2Fe-2S) domain protein  72.8 
 
 
379 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.47 
 
 
379 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314134  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.05 
 
 
379 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.820026  normal  0.0541114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.17 
 
 
383 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1568  Rieske (2Fe-2S) domain protein  69.15 
 
 
380 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2878  Rieske (2Fe-2S) protein  68.95 
 
 
385 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.49 
 
 
388 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2634  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  65.96 
 
 
386 aa  524  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456409  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2224  dioxygenase alpha subunit  66.02 
 
 
365 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  65.74 
 
 
365 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  65.74 
 
 
365 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0879  Rieske (2Fe-2S) region  65.29 
 
 
367 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0611  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.09 
 
 
368 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0327  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.36 
 
 
368 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2395  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.36 
 
 
370 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0845  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.36 
 
 
368 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2537  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.36 
 
 
368 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2214  Rieske (2Fe-2S) protein  63.99 
 
 
368 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458794  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1509  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.36 
 
 
368 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0361  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.36 
 
 
368 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.36 
 
 
368 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4489  Rieske (2Fe-2S) region  63.43 
 
 
368 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3651  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.43 
 
 
368 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3247  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.88 
 
 
368 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  normal  0.0195633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4823  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.16 
 
 
368 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158974  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3876  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.43 
 
 
368 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.6 
 
 
368 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134191  normal  0.0223706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6784  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.26 
 
 
368 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0426814  hitchhiker  0.000146793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3951  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.26 
 
 
368 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2618  Rieske (2Fe-2S) region  63.64 
 
 
367 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1815  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2830  putative osmotic adaptation-related protein  62.26 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1707  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.03 
 
 
368 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1425  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.33 
 
 
368 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.293584  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1711  Rieske (2Fe-2S) region  58.52 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.983866  hitchhiker  0.000992271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1777  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.54 
 
 
368 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.111763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3058  Rieske (2Fe-2S) region  58.52 
 
 
393 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312011  hitchhiker  0.000201005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  56.23 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  54.39 
 
 
365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.54 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.7 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.66 
 
 
385 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.12 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.17 
 
 
432 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  24.87 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.17 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 
390 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  31.02 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  24.53 
 
 
374 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.14 
 
 
373 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.21 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  24.53 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.53 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  24.53 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  24.53 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.53 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.53 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  24.66 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.53 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.3 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  26.9 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.27 
 
 
340 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.27 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.82 
 
 
383 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.24 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.8 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  25.14 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  24.53 
 
 
380 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  25.12 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  26.61 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  23.01 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
473 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  25 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.05 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4897  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  25.88 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227325  normal  0.4666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.82 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.86 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.35 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.35 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.35 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4719  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  26.52 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.54 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.09 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.575491 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.82 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.95 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  26.16 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.73 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3114  Rieske (2Fe-2S) region  30.65 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.11 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.18 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.26 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.1 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  23.32 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  24.18 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  22.73 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>