More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1773 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
383 aa  802    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.74 
 
 
392 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  37.15 
 
 
365 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.49 
 
 
396 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.52 
 
 
356 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.8 
 
 
398 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.7 
 
 
392 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 
390 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
401 aa  203  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.31 
 
 
394 aa  202  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.92 
 
 
390 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  29.07 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  29.01 
 
 
387 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.15 
 
 
358 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.23 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.65 
 
 
362 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  37.56 
 
 
387 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
445 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  31.92 
 
 
431 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  31.42 
 
 
414 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.84 
 
 
423 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  26.94 
 
 
380 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.52 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  32.65 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  25 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.18 
 
 
376 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
396 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
455 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.96 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  32.73 
 
 
429 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.49 
 
 
423 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.19 
 
 
456 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.69 
 
 
419 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1874  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.37 
 
 
436 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  33.52 
 
 
429 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.52 
 
 
430 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
429 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  35.29 
 
 
374 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.52 
 
 
430 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  26.2 
 
 
395 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  34.07 
 
 
432 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.83 
 
 
383 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.49 
 
 
387 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.07 
 
 
430 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  31.03 
 
 
455 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
455 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.31 
 
 
427 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  33.52 
 
 
410 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.67 
 
 
427 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  24.73 
 
 
393 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
384 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.44 
 
 
340 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
432 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.99 
 
 
403 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.52 
 
 
430 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1493  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.44 
 
 
437 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  32.84 
 
 
387 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.97 
 
 
430 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  32.42 
 
 
430 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.2 
 
 
469 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
413 aa  102  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  31.63 
 
 
427 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  25.6 
 
 
384 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.89 
 
 
427 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.5 
 
 
427 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
427 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.07 
 
 
444 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  26.51 
 
 
382 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.96 
 
 
424 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  28.24 
 
 
383 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  29.06 
 
 
437 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
422 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
422 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 
374 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 
374 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 
374 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  30 
 
 
413 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.09 
 
 
418 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
413 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.11 
 
 
373 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  29 
 
 
427 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.55 
 
 
422 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.55 
 
 
422 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  29.58 
 
 
464 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.55 
 
 
422 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
448 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  29.58 
 
 
464 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.55 
 
 
413 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
413 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  30.21 
 
 
374 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.13 
 
 
373 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 
427 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 
427 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.36 
 
 
360 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.21 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.16 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  30.21 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>