More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4273 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
356 aa  737    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  77.97 
 
 
365 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.38 
 
 
396 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
390 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.52 
 
 
383 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.11 
 
 
392 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.57 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.62 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  34.79 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.48 
 
 
398 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
390 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  26.59 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
376 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
384 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.21 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.5 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.45 
 
 
362 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.89 
 
 
362 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  27.6 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.6 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.6 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  27.6 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  27.6 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.6 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.6 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.84 
 
 
382 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  35.56 
 
 
444 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  27.32 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.32 
 
 
374 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  25.94 
 
 
387 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  30.99 
 
 
380 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  26.58 
 
 
373 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  35.44 
 
 
434 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
373 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.73 
 
 
448 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  31.72 
 
 
387 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  30.45 
 
 
414 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.75 
 
 
384 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
441 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  34.74 
 
 
445 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.22 
 
 
383 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
442 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.93 
 
 
432 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.81 
 
 
387 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  33.16 
 
 
382 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  26.7 
 
 
393 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.1 
 
 
423 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.52 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.5 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  30.84 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.5 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.5 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.06 
 
 
377 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0563  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0658  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617282  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5630  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1646  Rieske (2Fe-2S) region  28.17 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471832  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.52 
 
 
487 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.546967  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  26.71 
 
 
431 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  23.54 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.54 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.81 
 
 
449 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  35.09 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.39 
 
 
429 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 
469 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  25.34 
 
 
393 aa  93.6  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4957  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 
434 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  29.1 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  25.24 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0896  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.89 
 
 
400 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394642  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
455 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.44 
 
 
360 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.8 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.12 
 
 
423 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2752  putative terephthalate 1,2-dioxygenase, large subunit (TphA1)  30.94 
 
 
418 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.86 
 
 
418 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.02 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.75 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3114  Rieske (2Fe-2S) region  23.82 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4588  Rieske (2Fe-2S) region  28.64 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.818031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.64 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487989  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0203  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  28.17 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1378  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.17 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0616049  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  29.22 
 
 
427 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1575  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.17 
 
 
426 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.03 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0234  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.17 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  31.02 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  27.15 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.5 
 
 
424 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2325  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  31.58 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
455 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>