More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2624 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
384 aa  798    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 
392 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.07 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.21 
 
 
394 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.75 
 
 
390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.49 
 
 
392 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  28.33 
 
 
365 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.03 
 
 
396 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.2 
 
 
390 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.59 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.63 
 
 
398 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.53 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  29.92 
 
 
374 aa  126  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  29.92 
 
 
374 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.92 
 
 
374 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  29.92 
 
 
374 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.92 
 
 
374 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.92 
 
 
374 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  29.92 
 
 
374 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.65 
 
 
374 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  32.95 
 
 
401 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.65 
 
 
374 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.81 
 
 
376 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  26.68 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.23 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
374 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
374 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
374 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.69 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  37.43 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
419 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.6 
 
 
470 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.94 
 
 
383 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.86 
 
 
384 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
452 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.55 
 
 
423 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.7 
 
 
382 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.94 
 
 
443 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.47 
 
 
449 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.47 
 
 
449 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
384 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  33.16 
 
 
393 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  29.17 
 
 
373 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  35.68 
 
 
444 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  29.96 
 
 
393 aa  103  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.63 
 
 
373 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.69 
 
 
432 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.39 
 
 
412 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.7 
 
 
440 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0529  Rieske (2Fe-2S) protein  33.86 
 
 
387 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.27 
 
 
406 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.72 
 
 
340 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  36.7 
 
 
440 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.7 
 
 
440 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  26.76 
 
 
387 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
430 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.43 
 
 
423 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.38 
 
 
385 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3219  Rieske (2Fe-2S) region  36.46 
 
 
408 aa  99.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2770  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.51 
 
 
398 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0200185  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.23 
 
 
427 aa  99.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.86 
 
 
398 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
425 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.57 
 
 
473 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.62 
 
 
360 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  34.12 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  25.85 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.81 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.11 
 
 
442 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.13 
 
 
418 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.8 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
469 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  31.46 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  25.9 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.96 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  33.68 
 
 
430 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  35.12 
 
 
425 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.12 
 
 
425 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.12 
 
 
425 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.33 
 
 
427 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.86 
 
 
448 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.68 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.81 
 
 
427 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.32 
 
 
421 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.83 
 
 
429 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
425 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  29.82 
 
 
427 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
447 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2634  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  27.98 
 
 
450 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.03 
 
 
427 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
429 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.74 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.03 
 
 
427 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
448 aa  96.3  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
430 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  25.92 
 
 
464 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.5 
 
 
423 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>