More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3483 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
394 aa  830    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.32 
 
 
392 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  36.32 
 
 
401 aa  243  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 
396 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.31 
 
 
383 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  33.52 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.62 
 
 
356 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.54 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.77 
 
 
390 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.96 
 
 
398 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.54 
 
 
392 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  29.21 
 
 
384 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.78 
 
 
362 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.47 
 
 
425 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.47 
 
 
425 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  34.47 
 
 
425 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.32 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.69 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  29.41 
 
 
414 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
384 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  28.66 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.01 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.23 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.37 
 
 
432 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.71 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.29 
 
 
383 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.39 
 
 
429 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.54 
 
 
423 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.06 
 
 
421 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.63 
 
 
425 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  32.72 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
419 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  27.75 
 
 
434 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.44 
 
 
443 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.47 
 
 
406 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0558  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
463 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.559432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
463 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548645  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1666  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
463 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0640  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
463 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409215  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
463 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726822  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1690  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
463 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.22 
 
 
374 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.22 
 
 
374 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.22 
 
 
374 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.27 
 
 
427 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5458  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
447 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5855  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
447 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0274508  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0525  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.61 
 
 
463 aa  106  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110269  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.65 
 
 
430 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  29.91 
 
 
444 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.13 
 
 
429 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  28.63 
 
 
425 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.63 
 
 
425 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.63 
 
 
425 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.81 
 
 
418 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.78 
 
 
358 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.76 
 
 
423 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  26.51 
 
 
387 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  26.1 
 
 
380 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  23.55 
 
 
393 aa  103  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.15 
 
 
430 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.43 
 
 
384 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.5 
 
 
418 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
470 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.52 
 
 
487 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.08 
 
 
412 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  26.96 
 
 
427 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  25.95 
 
 
382 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.63 
 
 
429 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.13 
 
 
444 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.27 
 
 
374 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.35 
 
 
430 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.27 
 
 
374 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.27 
 
 
374 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  26.27 
 
 
374 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.27 
 
 
374 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
427 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  26.27 
 
 
374 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.27 
 
 
374 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
427 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.27 
 
 
374 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.27 
 
 
374 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2688  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  30.59 
 
 
457 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  29.35 
 
 
432 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0896  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.83 
 
 
400 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394642  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0529  Rieske (2Fe-2S) protein  26.69 
 
 
387 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.78 
 
 
385 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.26 
 
 
427 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0685  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.31 
 
 
484 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  30.59 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.65 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  28.36 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.26 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  26.91 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0463  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.46 
 
 
484 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.328369  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.26 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.96 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>