More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0146 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
358 aa  733    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.57 
 
 
362 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.57 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.51 
 
 
355 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  30.34 
 
 
434 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  31.04 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2170  hypothetical protein  28.74 
 
 
361 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2143  hypothetical protein  28.45 
 
 
361 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0721  Choline monooxygenase  31.16 
 
 
362 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.651442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  30.43 
 
 
431 aa  155  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.76 
 
 
369 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.26 
 
 
382 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  29.71 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.6 
 
 
360 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2803  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.51 
 
 
366 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  29.71 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.71 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  29.71 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  29.71 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 
374 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.22 
 
 
340 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.53 
 
 
384 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.61 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.53 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  32.03 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  29.01 
 
 
387 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.76 
 
 
377 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.28 
 
 
384 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  27.25 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.15 
 
 
383 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 
374 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 
374 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 
374 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  30.11 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.2 
 
 
377 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  29.97 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.24 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  28.86 
 
 
387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.12 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  29.94 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.97 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  29.38 
 
 
385 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
385 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  28.89 
 
 
384 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.79 
 
 
382 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  27.14 
 
 
380 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.87 
 
 
412 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3019  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.97 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.866348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  27.88 
 
 
388 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 
406 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.98 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.28 
 
 
403 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.24 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  30.23 
 
 
384 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.34 
 
 
408 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0529  Rieske (2Fe-2S) protein  26.09 
 
 
387 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  26.78 
 
 
370 aa  112  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  27.43 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.66 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  29.49 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  27.73 
 
 
410 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  28.85 
 
 
387 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.6 
 
 
369 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  25.35 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3114  Rieske (2Fe-2S) region  23.9 
 
 
367 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
430 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.98 
 
 
413 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  25.2 
 
 
396 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.02 
 
 
413 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.26 
 
 
430 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.4 
 
 
398 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  25.98 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  27.07 
 
 
365 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
430 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
430 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
424 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 
455 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.66 
 
 
456 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  27.15 
 
 
437 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.77 
 
 
413 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.84 
 
 
390 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  25.57 
 
 
445 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  27.31 
 
 
429 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  25.72 
 
 
413 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.72 
 
 
413 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.72 
 
 
413 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.38 
 
 
430 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
425 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.78 
 
 
394 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  28.5 
 
 
425 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.98 
 
 
426 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
425 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>