More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5836 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
373 aa  785    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.14 
 
 
382 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.86 
 
 
373 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.58 
 
 
374 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.58 
 
 
374 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.58 
 
 
374 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  49.03 
 
 
374 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.03 
 
 
374 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  49.03 
 
 
374 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.75 
 
 
374 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  49.03 
 
 
374 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.03 
 
 
374 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  49.03 
 
 
374 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.03 
 
 
374 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.75 
 
 
374 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  43.22 
 
 
380 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.57 
 
 
360 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.82 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3019  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
387 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.866348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.54 
 
 
362 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  32.71 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  31.34 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  31.11 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.26 
 
 
340 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0529  Rieske (2Fe-2S) protein  28.85 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.29 
 
 
377 aa  173  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.89 
 
 
373 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.4 
 
 
377 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  32.5 
 
 
434 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  32.77 
 
 
376 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  30.26 
 
 
385 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.26 
 
 
385 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.26 
 
 
369 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
385 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.73 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  30.39 
 
 
431 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.52 
 
 
355 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.29 
 
 
384 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.84 
 
 
398 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  30.95 
 
 
393 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  29.82 
 
 
387 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
376 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.86 
 
 
432 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.82 
 
 
385 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  29.91 
 
 
393 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.29 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  27.52 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.11 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.57 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  27.86 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4728  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.03 
 
 
336 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.19 
 
 
408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.01 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  27.92 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  36.32 
 
 
382 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.55 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.99 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  32.52 
 
 
432 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  31.55 
 
 
430 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  26.7 
 
 
414 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.52 
 
 
430 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  33.01 
 
 
410 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.18 
 
 
421 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.52 
 
 
430 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58359  predicted protein  35.53 
 
 
218 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00818873  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  35.12 
 
 
413 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.43 
 
 
406 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.12 
 
 
422 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.12 
 
 
422 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.2 
 
 
410 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  34.15 
 
 
413 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
430 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
413 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.14 
 
 
413 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
422 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
422 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
422 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  32.51 
 
 
445 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  29.19 
 
 
384 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  31.03 
 
 
429 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  31.03 
 
 
429 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  33.66 
 
 
413 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
413 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
413 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.45 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.96 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.63 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.15 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.63 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2803  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.35 
 
 
366 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.17 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.19 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.62 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.63 
 
 
426 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.15 
 
 
419 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1189  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
450 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.41 
 
 
412 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>