More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0074 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
396 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  75.28 
 
 
365 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.38 
 
 
356 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.37 
 
 
392 aa  239  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
390 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.49 
 
 
383 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.69 
 
 
392 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.68 
 
 
398 aa  205  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 
394 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  34.92 
 
 
401 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.24 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  27.03 
 
 
384 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.67 
 
 
406 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  34.91 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.96 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.07 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.56 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.78 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.58 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  26.67 
 
 
393 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  25.29 
 
 
387 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.12 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  27.76 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.94 
 
 
432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.7 
 
 
340 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  34.85 
 
 
374 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.01 
 
 
385 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.72 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.19 
 
 
413 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.32 
 
 
423 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
382 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3667  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.24 
 
 
429 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.42 
 
 
448 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0563  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.23 
 
 
393 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.23 
 
 
393 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.546967  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0658  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.23 
 
 
393 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.23 
 
 
393 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617282  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5630  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.23 
 
 
393 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  27.6 
 
 
373 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4588  Rieske (2Fe-2S) region  31.31 
 
 
435 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.818031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.31 
 
 
435 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487989  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  29.95 
 
 
387 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1646  Rieske (2Fe-2S) region  31.75 
 
 
393 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.75 
 
 
393 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.31 
 
 
444 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261439  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.96 
 
 
384 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.75 
 
 
393 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  28.67 
 
 
396 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  35 
 
 
380 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 
374 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  25.82 
 
 
431 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
423 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171492  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  30.52 
 
 
445 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  26.24 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.24 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.29 
 
 
427 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.24 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  26.24 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 
374 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  29.33 
 
 
395 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4957  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
434 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.14 
 
 
429 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0896  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
400 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394642  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2325  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  29.55 
 
 
435 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0488  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  30.37 
 
 
425 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1121  anthranilate dioxygenase, large subunit (AndAc)  30.84 
 
 
423 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279249  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1378  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.84 
 
 
425 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0616049  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0203  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  30.84 
 
 
425 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0983  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  30.84 
 
 
425 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.57 
 
 
442 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2707  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.84 
 
 
425 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  26.18 
 
 
393 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2563  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.84 
 
 
425 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1575  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.84 
 
 
426 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0234  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.84 
 
 
425 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  25.97 
 
 
374 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.97 
 
 
374 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.74 
 
 
487 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1108  anthranilate dioxygenase, large subunit (AndAc)  30.37 
 
 
423 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803473  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.44 
 
 
397 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.8 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.2 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.62 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 
469 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.18 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  30.73 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.73 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  32.45 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  30.41 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.73 
 
 
455 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.08 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.06 
 
 
369 aa  97.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  29.14 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  31.91 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2752  putative terephthalate 1,2-dioxygenase, large subunit (TphA1)  32.35 
 
 
418 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.2 
 
 
421 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.59 
 
 
358 aa  96.3  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>