More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0190 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 
365 aa  756    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  77.97 
 
 
356 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.28 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.15 
 
 
383 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.36 
 
 
390 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.36 
 
 
392 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.63 
 
 
392 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  35.73 
 
 
401 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.52 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.85 
 
 
390 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  28.33 
 
 
384 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.61 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.65 
 
 
376 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.85 
 
 
443 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  26.42 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
374 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  26.56 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.56 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.56 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  26.56 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.17 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  32.65 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.29 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.29 
 
 
374 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.12 
 
 
383 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.89 
 
 
362 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
373 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.03 
 
 
384 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  29.03 
 
 
431 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  31.43 
 
 
380 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.07 
 
 
448 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  27.7 
 
 
393 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  26.74 
 
 
373 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  34.17 
 
 
414 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  33.01 
 
 
382 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.6 
 
 
385 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.37 
 
 
358 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.34 
 
 
387 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.96 
 
 
382 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  28.08 
 
 
434 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.07 
 
 
340 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
374 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
374 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
374 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  34.17 
 
 
374 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  29.79 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  31.78 
 
 
380 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.85 
 
 
382 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.44 
 
 
442 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.52 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  30.88 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.09 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  31.87 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2707  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.77 
 
 
425 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0983  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  29.77 
 
 
425 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2563  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.77 
 
 
425 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1378  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.77 
 
 
425 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0616049  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0203  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  29.77 
 
 
425 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0234  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.77 
 
 
425 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0896  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
400 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394642  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1575  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.77 
 
 
426 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.87 
 
 
448 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0488  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase alpha-ISP protein OhbB  29.3 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.22 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3114  Rieske (2Fe-2S) region  24.19 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
469 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0529  Rieske (2Fe-2S) protein  28.9 
 
 
387 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2752  putative terephthalate 1,2-dioxygenase, large subunit (TphA1)  30.87 
 
 
418 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.08 
 
 
391 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45564  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  32.65 
 
 
455 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 
441 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
455 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.89 
 
 
423 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.84 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.575491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.04 
 
 
427 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.04 
 
 
427 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.67 
 
 
403 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.1 
 
 
427 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
455 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1121  anthranilate dioxygenase, large subunit (AndAc)  29.3 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.24 
 
 
365 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
473 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  24.71 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.32 
 
 
430 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  27.87 
 
 
427 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.02 
 
 
427 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  30.71 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1108  anthranilate dioxygenase, large subunit (AndAc)  28.84 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803473  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
431 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
436 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.64 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.5 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>