More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1801 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
401 aa  836    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.36 
 
 
394 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.575491 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.61 
 
 
376 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.97 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  30.89 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.38 
 
 
384 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  30.66 
 
 
382 aa  169  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.96 
 
 
384 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  31.15 
 
 
387 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.73 
 
 
383 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.55 
 
 
362 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.62 
 
 
362 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  28.41 
 
 
387 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 
432 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  35.1 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.83 
 
 
448 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.83 
 
 
427 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  25.72 
 
 
376 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.77 
 
 
373 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.83 
 
 
427 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  31.91 
 
 
445 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  32.52 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.04 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.04 
 
 
427 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.04 
 
 
427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  34.76 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  27.76 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  26.93 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  32.64 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.13 
 
 
374 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  25.26 
 
 
384 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.13 
 
 
374 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  32.64 
 
 
429 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.13 
 
 
374 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.16 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  27.76 
 
 
374 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  27.76 
 
 
374 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.76 
 
 
374 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.76 
 
 
374 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  27.76 
 
 
374 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.76 
 
 
374 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.84 
 
 
374 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.17 
 
 
441 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  28.68 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  26.46 
 
 
393 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.65 
 
 
430 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.75 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.65 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.81 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.6 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.48 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.8 
 
 
373 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  30.07 
 
 
423 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.08 
 
 
429 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.67 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  25.65 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.77 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  24.5 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.72 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  27.53 
 
 
393 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.34 
 
 
423 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.1 
 
 
425 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.75 
 
 
424 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2752  putative terephthalate 1,2-dioxygenase, large subunit (TphA1)  35.59 
 
 
418 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.54 
 
 
433 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  24.87 
 
 
432 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.27 
 
 
385 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5352  benzoate 1,2-dioxygenase, large subunit  31.42 
 
 
455 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
440 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.42 
 
 
414 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  33 
 
 
440 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
440 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
340 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.9 
 
 
449 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.16 
 
 
427 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.9 
 
 
449 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
430 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.88 
 
 
470 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.48 
 
 
430 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  26.57 
 
 
405 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 
429 aa  106  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
444 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  24.61 
 
 
395 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.58 
 
 
414 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
421 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.31 
 
 
410 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  32.14 
 
 
373 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.9 
 
 
385 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  26.33 
 
 
405 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0662  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.8 
 
 
455 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0529  Rieske (2Fe-2S) protein  31.19 
 
 
387 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.68 
 
 
418 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  25.29 
 
 
383 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.44 
 
 
452 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  30.05 
 
 
410 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
425 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0488  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.88 
 
 
455 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5626  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.88 
 
 
458 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>