More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1707 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1707  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
368 aa  770    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1425  Rieske (2Fe-2S) domain protein  91.85 
 
 
368 aa  714    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.293584  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2618  Rieske (2Fe-2S) region  79.4 
 
 
367 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1815  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  78.3 
 
 
365 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0879  Rieske (2Fe-2S) region  77.05 
 
 
367 aa  614  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  78.57 
 
 
365 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2224  dioxygenase alpha subunit  77.75 
 
 
365 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3651  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.05 
 
 
368 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2214  Rieske (2Fe-2S) protein  72.33 
 
 
368 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458794  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0611  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.78 
 
 
368 aa  544  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4823  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.05 
 
 
368 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158974  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2830  putative osmotic adaptation-related protein  71.23 
 
 
368 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4489  Rieske (2Fe-2S) region  72.05 
 
 
368 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3876  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.05 
 
 
368 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0327  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.51 
 
 
368 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1509  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.51 
 
 
368 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2537  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.51 
 
 
368 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0845  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.51 
 
 
368 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2395  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.51 
 
 
370 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0361  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.51 
 
 
368 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6784  Rieske (2Fe-2S) domain protein  70.96 
 
 
368 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0426814  hitchhiker  0.000146793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.78 
 
 
368 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134191  normal  0.0223706 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.51 
 
 
368 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3951  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.23 
 
 
368 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3247  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.78 
 
 
368 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  normal  0.0195633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1777  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66.12 
 
 
368 aa  510  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.111763  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0953  Rieske (2Fe-2S) domain protein  65.78 
 
 
379 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1035  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.78 
 
 
379 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.51 
 
 
379 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.820026  normal  0.0541114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.78 
 
 
379 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314134  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.84 
 
 
383 aa  500  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.51 
 
 
388 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3058  Rieske (2Fe-2S) region  64.15 
 
 
393 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312011  hitchhiker  0.000201005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1568  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.85 
 
 
380 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  63.01 
 
 
370 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2878  Rieske (2Fe-2S) protein  62.4 
 
 
385 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1744  Rieske (2Fe-2S) region  62.87 
 
 
376 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2634  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  61.98 
 
 
386 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456409  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.03 
 
 
372 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1711  Rieske (2Fe-2S) region  60.54 
 
 
374 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.983866  hitchhiker  0.000992271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  60.61 
 
 
365 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.8 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.08 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  35.85 
 
 
382 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.44 
 
 
432 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.09 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  26.47 
 
 
420 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.49 
 
 
358 aa  95.9  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.67 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.29 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  28.03 
 
 
383 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.13 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.98 
 
 
398 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  28.12 
 
 
373 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.9 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.28 
 
 
423 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  31.66 
 
 
365 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.01 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.37 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  29.76 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.46 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.85 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.74 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  25.75 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.27 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.68 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.18 
 
 
473 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.21 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  25.68 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  23.77 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  25.68 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.68 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.31 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.68 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.68 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  25.68 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  25.68 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  33.68 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  33.68 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  27.05 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.41 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  27.04 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.19 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.88 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.98 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.41 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.49 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  33.49 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  32.84 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.49 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.73 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.64 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  26.09 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>