More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3773 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0327  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  92.12 
 
 
368 aa  714    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2537  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  92.12 
 
 
368 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0845  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  92.12 
 
 
368 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2214  Rieske (2Fe-2S) protein  97.28 
 
 
368 aa  754    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458794  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0611  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  93.21 
 
 
368 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  92.12 
 
 
368 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2830  putative osmotic adaptation-related protein  86.41 
 
 
368 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
368 aa  769    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134191  normal  0.0223706 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2395  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  92.12 
 
 
370 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4489  Rieske (2Fe-2S) region  98.64 
 
 
368 aa  760    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0361  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  92.12 
 
 
368 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6784  Rieske (2Fe-2S) domain protein  85.87 
 
 
368 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0426814  hitchhiker  0.000146793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4823  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  96.47 
 
 
368 aa  747    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158974  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3247  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.46 
 
 
368 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  normal  0.0195633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3951  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  84.51 
 
 
368 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3651  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  98.64 
 
 
368 aa  760    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3876  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  98.64 
 
 
368 aa  760    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1509  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  92.12 
 
 
368 aa  714    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2224  dioxygenase alpha subunit  74.1 
 
 
365 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0879  Rieske (2Fe-2S) region  72.13 
 
 
367 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  72.88 
 
 
365 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  73.28 
 
 
365 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2618  Rieske (2Fe-2S) region  73.28 
 
 
367 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1815  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1707  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.78 
 
 
368 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0953  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.73 
 
 
379 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1035  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.47 
 
 
379 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.29 
 
 
383 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1425  Rieske (2Fe-2S) domain protein  68.6 
 
 
368 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.293584  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.6 
 
 
379 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314134  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.36 
 
 
379 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.820026  normal  0.0541114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1744  Rieske (2Fe-2S) region  62.8 
 
 
376 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.4 
 
 
388 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1568  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.1 
 
 
380 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.6 
 
 
372 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2634  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  63.02 
 
 
386 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456409  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  62.63 
 
 
370 aa  481  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1711  Rieske (2Fe-2S) region  64.96 
 
 
374 aa  481  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.983866  hitchhiker  0.000992271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2878  Rieske (2Fe-2S) protein  60.78 
 
 
385 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  62.19 
 
 
365 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1777  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.71 
 
 
368 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.111763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3058  Rieske (2Fe-2S) region  61.19 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312011  hitchhiker  0.000201005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.85 
 
 
362 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.7 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.84 
 
 
432 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
417 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.4 
 
 
374 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  26.4 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.4 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.4 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  26.4 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.4 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.4 
 
 
374 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.14 
 
 
374 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.14 
 
 
385 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.14 
 
 
374 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.08 
 
 
373 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.39 
 
 
398 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.98 
 
 
384 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  24.47 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.17 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.88 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.48 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.27 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  23.39 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.05 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.13 
 
 
423 aa  95.9  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.07 
 
 
374 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.07 
 
 
374 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.07 
 
 
374 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
384 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  25.83 
 
 
431 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  30.5 
 
 
387 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.45 
 
 
421 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  33.33 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.85 
 
 
408 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.1 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.86 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.6 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.92 
 
 
473 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.95 
 
 
423 aa  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  30.26 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.47 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.9 
 
 
387 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.38 
 
 
437 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.94 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  24.46 
 
 
393 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  29.13 
 
 
401 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.81 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
413 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  23.64 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  32.02 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.62 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.53 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  27.8 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.02 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.02 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.89 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.29 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>