More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2878 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2878  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 
385 aa  806    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  77.69 
 
 
379 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314134  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1568  Rieske (2Fe-2S) domain protein  73.58 
 
 
380 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1035  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.07 
 
 
379 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0953  Rieske (2Fe-2S) domain protein  75.07 
 
 
379 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.15 
 
 
379 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.820026  normal  0.0541114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.02 
 
 
383 aa  577  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1744  Rieske (2Fe-2S) region  69.21 
 
 
376 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.61 
 
 
388 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.95 
 
 
372 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2634  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  64.39 
 
 
386 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456409  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2224  dioxygenase alpha subunit  64.92 
 
 
365 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.23 
 
 
365 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.66 
 
 
365 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0879  Rieske (2Fe-2S) region  64.75 
 
 
367 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2618  Rieske (2Fe-2S) region  63.61 
 
 
367 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1815  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0327  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.4 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0845  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.4 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0361  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.4 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0611  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.14 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1509  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.4 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2537  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.4 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2395  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.4 
 
 
370 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  62.4 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1707  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.4 
 
 
368 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3951  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.14 
 
 
368 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3651  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.78 
 
 
368 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2214  Rieske (2Fe-2S) protein  61.04 
 
 
368 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458794  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6784  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.1 
 
 
368 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0426814  hitchhiker  0.000146793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4489  Rieske (2Fe-2S) region  60.78 
 
 
368 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3247  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.04 
 
 
368 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  normal  0.0195633 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3876  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.78 
 
 
368 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.78 
 
 
368 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134191  normal  0.0223706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4823  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.26 
 
 
368 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158974  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2830  putative osmotic adaptation-related protein  61.1 
 
 
368 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1425  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.77 
 
 
368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.293584  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1777  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.9 
 
 
368 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.111763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3058  Rieske (2Fe-2S) region  58.1 
 
 
393 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312011  hitchhiker  0.000201005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  55.5 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1711  Rieske (2Fe-2S) region  53.93 
 
 
374 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.983866  hitchhiker  0.000992271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  52.23 
 
 
365 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.45 
 
 
362 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.13 
 
 
362 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.56 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.33 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.07 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.08 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  23.65 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  22.54 
 
 
380 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  29.31 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  25.18 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.88 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  23.37 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  23.89 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  24.25 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  26.79 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  25.06 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  23.21 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.32 
 
 
432 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  23.21 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.21 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  23.21 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  25.36 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.64 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.21 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.21 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  23.21 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.94 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  23.58 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.96 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.12 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.66 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.79 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.92 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1090  putative salicylate-5-hydroxylase large oxygenase component oxidoreductase protein  25.97 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580229  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  22.28 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.69 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.33 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.96 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.01 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  22.55 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.45 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
383 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.98 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  22.3 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.05 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423018  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.4 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.3 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  22.54 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5349  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.92 
 
 
421 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.16 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  24.6 
 
 
416 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  28.02 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3114  Rieske (2Fe-2S) region  28.1 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.14 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.14 
 
 
434 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.01 
 
 
403 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>