More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2224 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2224  dioxygenase alpha subunit  100 
 
 
365 aa  761    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0879  Rieske (2Fe-2S) region  84.11 
 
 
367 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  95.07 
 
 
365 aa  727    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  94.79 
 
 
365 aa  726    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2618  Rieske (2Fe-2S) region  83.84 
 
 
367 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1815  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1707  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  77.75 
 
 
368 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1425  Rieske (2Fe-2S) domain protein  75.34 
 
 
368 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.293584  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2214  Rieske (2Fe-2S) protein  74.93 
 
 
368 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458794  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3651  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.66 
 
 
368 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4489  Rieske (2Fe-2S) region  74.66 
 
 
368 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3876  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.66 
 
 
368 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0611  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.7 
 
 
368 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.1 
 
 
368 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134191  normal  0.0223706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3247  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.1 
 
 
368 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  normal  0.0195633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3951  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73 
 
 
368 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6784  Rieske (2Fe-2S) domain protein  73.28 
 
 
368 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0426814  hitchhiker  0.000146793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4823  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.15 
 
 
368 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158974  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0361  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.15 
 
 
368 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.15 
 
 
368 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1509  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.15 
 
 
368 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0327  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.15 
 
 
368 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0845  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.15 
 
 
368 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2537  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.15 
 
 
368 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2395  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.15 
 
 
370 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2830  putative osmotic adaptation-related protein  72.73 
 
 
368 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1035  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.65 
 
 
379 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0953  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.91 
 
 
379 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.04 
 
 
379 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.820026  normal  0.0541114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.31 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.84 
 
 
383 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.02 
 
 
372 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.51 
 
 
379 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314134  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1744  Rieske (2Fe-2S) region  65.04 
 
 
376 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2878  Rieske (2Fe-2S) protein  64.92 
 
 
385 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1777  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.84 
 
 
368 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.111763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1568  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.76 
 
 
380 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3058  Rieske (2Fe-2S) region  63.61 
 
 
393 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312011  hitchhiker  0.000201005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2634  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  64.74 
 
 
386 aa  494  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456409  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1711  Rieske (2Fe-2S) region  62.57 
 
 
374 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.983866  hitchhiker  0.000992271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  62.02 
 
 
370 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  59.89 
 
 
365 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.5 
 
 
362 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.99 
 
 
358 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
376 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  33.63 
 
 
382 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.94 
 
 
385 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.37 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
401 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
384 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.09 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  25.33 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.42 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.62 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.82 
 
 
398 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.38 
 
 
423 aa  89.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.87 
 
 
437 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  26.13 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.13 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.13 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4290  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.18 
 
 
435 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  26.13 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.13 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.94 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.13 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  26.13 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.88 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1090  putative salicylate-5-hydroxylase large oxygenase component oxidoreductase protein  40.74 
 
 
418 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580229  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  29.27 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  31.58 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  25.39 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  33.86 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.67 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.67 
 
 
417 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  27.25 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  28.9 
 
 
393 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.06 
 
 
427 aa  86.3  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.16 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  24.76 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.88 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  25.48 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  34.38 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.54 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.22 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  26.59 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.65 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.87 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  24.74 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  28.8 
 
 
434 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  27.96 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  34.87 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>