More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2239 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  85.68 
 
 
379 aa  685    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314134  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
379 aa  792    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.820026  normal  0.0541114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1035  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  87.23 
 
 
379 aa  707    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0953  Rieske (2Fe-2S) domain protein  87.5 
 
 
379 aa  708    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579213  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  77.13 
 
 
383 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2878  Rieske (2Fe-2S) protein  74.15 
 
 
385 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1744  Rieske (2Fe-2S) region  71.05 
 
 
376 aa  567  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.05 
 
 
372 aa  567  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1568  Rieske (2Fe-2S) domain protein  69.55 
 
 
380 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.73 
 
 
388 aa  548  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0879  Rieske (2Fe-2S) region  68 
 
 
367 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3951  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.93 
 
 
368 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6784  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66.4 
 
 
368 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0426814  hitchhiker  0.000146793 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0361  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.13 
 
 
368 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2224  dioxygenase alpha subunit  66.04 
 
 
365 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2395  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.13 
 
 
370 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0327  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.13 
 
 
368 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0845  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.13 
 
 
368 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.13 
 
 
368 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1509  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.13 
 
 
368 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2537  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.13 
 
 
368 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4823  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.16 
 
 
368 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158974  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2214  Rieske (2Fe-2S) protein  65.43 
 
 
368 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458794  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0611  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  65.6 
 
 
368 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2830  putative osmotic adaptation-related protein  66.13 
 
 
368 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3247  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.63 
 
 
368 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  normal  0.0195633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  65.24 
 
 
365 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3651  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.89 
 
 
368 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4489  Rieske (2Fe-2S) region  64.89 
 
 
368 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.36 
 
 
368 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134191  normal  0.0223706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  65.07 
 
 
365 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3876  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.89 
 
 
368 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2618  Rieske (2Fe-2S) region  65.78 
 
 
367 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1815  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1707  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.51 
 
 
368 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2634  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  64.69 
 
 
386 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456409  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1425  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.07 
 
 
368 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.293584  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1777  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.43 
 
 
368 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.111763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3058  Rieske (2Fe-2S) region  58.91 
 
 
393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312011  hitchhiker  0.000201005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  59.03 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1711  Rieske (2Fe-2S) region  56.74 
 
 
374 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.983866  hitchhiker  0.000992271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  54.47 
 
 
365 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.18 
 
 
362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.56 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.21 
 
 
384 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  26.23 
 
 
380 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.15 
 
 
390 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  25.45 
 
 
374 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  27.15 
 
 
380 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  25.06 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
376 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  24.81 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.81 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.81 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  24.81 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  24.81 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.81 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.56 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.33 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.46 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  25.19 
 
 
384 aa  92.8  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.56 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.73 
 
 
432 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.69 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.72 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  25.72 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.87 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  26.68 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  32.11 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.29 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.62 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  25.67 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.53 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.57 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.07 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.07 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.07 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  29.21 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.75 
 
 
383 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
473 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  27.88 
 
 
393 aa  86.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.14 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.54 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  27.51 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.75 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.37 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.02 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  25.34 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.37 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  26.02 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.55 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.55 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  32.55 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.61 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.11 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.77 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.24 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.63 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.98 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>