More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1568 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1568  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
380 aa  797    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2878  Rieske (2Fe-2S) protein  73.58 
 
 
385 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.75 
 
 
379 aa  597  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314134  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0953  Rieske (2Fe-2S) domain protein  73.49 
 
 
379 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1035  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.49 
 
 
379 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.92 
 
 
383 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1744  Rieske (2Fe-2S) region  71.28 
 
 
376 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.44 
 
 
388 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.55 
 
 
379 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.820026  normal  0.0541114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.15 
 
 
372 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.91 
 
 
365 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.64 
 
 
365 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2634  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  65.22 
 
 
386 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456409  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0327  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.64 
 
 
368 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0845  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.64 
 
 
368 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.64 
 
 
368 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0361  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.64 
 
 
368 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2618  Rieske (2Fe-2S) region  63.76 
 
 
367 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1815  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2395  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.64 
 
 
370 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1509  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.64 
 
 
368 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2537  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.64 
 
 
368 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2224  dioxygenase alpha subunit  63.76 
 
 
365 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0879  Rieske (2Fe-2S) region  64.29 
 
 
367 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0611  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.12 
 
 
368 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3951  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.85 
 
 
368 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3247  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.36 
 
 
368 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  normal  0.0195633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6784  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.06 
 
 
368 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0426814  hitchhiker  0.000146793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4823  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.59 
 
 
368 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158974  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2214  Rieske (2Fe-2S) protein  64.36 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458794  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2830  putative osmotic adaptation-related protein  63.32 
 
 
368 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4489  Rieske (2Fe-2S) region  64.36 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.1 
 
 
368 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134191  normal  0.0223706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3651  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.36 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3876  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.36 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1707  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.85 
 
 
368 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1425  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.48 
 
 
368 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.293584  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3058  Rieske (2Fe-2S) region  58.1 
 
 
393 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312011  hitchhiker  0.000201005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1777  Rieske (2Fe-2S) domain protein  57.26 
 
 
368 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.111763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1711  Rieske (2Fe-2S) region  57.22 
 
 
374 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.983866  hitchhiker  0.000992271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  56.2 
 
 
370 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  52.79 
 
 
365 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.23 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.34 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.7 
 
 
385 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.26 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  25.62 
 
 
393 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  23.97 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  28.65 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  24.8 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  25.26 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  25.26 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.26 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.26 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  25.26 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  25.26 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.26 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  23.32 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.42 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.92 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.87 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  24.87 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  24.6 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  25.13 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  25.45 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  28.83 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  24.82 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.96 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  25.06 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  24.57 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.51 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.1 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2770  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0200185  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  23.92 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  23.86 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.9 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.15 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.3 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.3 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.16 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.16 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.16 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.68 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  23.66 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  23.34 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  33.17 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.66 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  31.84 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  23.86 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.34 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.09 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.84 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.4 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.84 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>