More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2618 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2224  dioxygenase alpha subunit  83.84 
 
 
365 aa  670    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0879  Rieske (2Fe-2S) region  89.1 
 
 
367 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2429  Rieske (2Fe-2S) domain protein  83.84 
 
 
365 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.979535  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2036  Rieske (2Fe-2S) domain protein  84.11 
 
 
365 aa  673    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0969359  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2618  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
367 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1815  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1707  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  79.4 
 
 
368 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1425  Rieske (2Fe-2S) domain protein  77.53 
 
 
368 aa  611  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.293584  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2214  Rieske (2Fe-2S) protein  73.83 
 
 
368 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458794  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0611  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  73.15 
 
 
368 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3651  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.55 
 
 
368 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4489  Rieske (2Fe-2S) region  73.55 
 
 
368 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3876  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.55 
 
 
368 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.249656 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1509  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  72.88 
 
 
368 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0327  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  72.88 
 
 
368 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0845  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  72.88 
 
 
368 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  72.88 
 
 
368 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2537  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  72.88 
 
 
368 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0361  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  72.88 
 
 
368 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2395  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  72.88 
 
 
370 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.28 
 
 
368 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134191  normal  0.0223706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3247  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.28 
 
 
368 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  normal  0.0195633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3951  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.73 
 
 
368 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4823  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.33 
 
 
368 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158974  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2830  putative osmotic adaptation-related protein  70.8 
 
 
368 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6784  Rieske (2Fe-2S) domain protein  70.8 
 
 
368 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0426814  hitchhiker  0.000146793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0953  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.11 
 
 
379 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.579213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1035  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.11 
 
 
379 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.84 
 
 
388 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.31 
 
 
379 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314134  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.78 
 
 
379 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.820026  normal  0.0541114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1777  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.74 
 
 
368 aa  501  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.111763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.58 
 
 
383 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1568  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.76 
 
 
380 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3058  Rieske (2Fe-2S) region  62.53 
 
 
393 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312011  hitchhiker  0.000201005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2878  Rieske (2Fe-2S) protein  63.61 
 
 
385 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1744  Rieske (2Fe-2S) region  62.73 
 
 
376 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2634  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  63.99 
 
 
386 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456409  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.64 
 
 
372 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0882  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  62.02 
 
 
370 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1711  Rieske (2Fe-2S) region  58.92 
 
 
374 aa  478  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.983866  hitchhiker  0.000992271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0233  Rieske (2Fe-2S) region  59.62 
 
 
365 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0567601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.85 
 
 
362 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.3 
 
 
362 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.41 
 
 
385 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.4 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.97 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  32.89 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  24.93 
 
 
380 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.96 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.13 
 
 
412 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.39 
 
 
384 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.38 
 
 
398 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.87 
 
 
417 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.63 
 
 
384 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1090  putative salicylate-5-hydroxylase large oxygenase component oxidoreductase protein  40.68 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580229  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.41 
 
 
417 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.12 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  27.66 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.6 
 
 
383 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.59 
 
 
374 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.67 
 
 
437 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  25.25 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  28.78 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.59 
 
 
374 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  26.02 
 
 
384 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.59 
 
 
374 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.25 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  25.25 
 
 
374 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.25 
 
 
374 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.25 
 
 
374 aa  87  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  25.25 
 
 
374 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  25.25 
 
 
374 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.25 
 
 
374 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.88 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.65 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  31.88 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.05 
 
 
387 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.33 
 
 
390 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.34 
 
 
373 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  30.53 
 
 
387 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  27.54 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0721  Choline monooxygenase  27.27 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.651442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.58 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  24.73 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.71 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  24.08 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.39 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  32.32 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  32.32 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1889  Rieske (2Fe-2S) protein  25.59 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.099621  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.93 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4719  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  42.45 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2803  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.8 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  33.33 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>