More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3396 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  87.11 
 
 
419 aa  764    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
419 aa  878    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  91.17 
 
 
419 aa  815    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  90.69 
 
 
419 aa  813    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  90.93 
 
 
419 aa  815    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  65.05 
 
 
422 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  65.28 
 
 
413 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  65.28 
 
 
413 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  65.05 
 
 
422 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  65.04 
 
 
413 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.81 
 
 
422 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.81 
 
 
422 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  64.81 
 
 
422 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.55 
 
 
413 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  64.06 
 
 
413 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.2 
 
 
426 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.33 
 
 
413 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.33 
 
 
413 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.08 
 
 
413 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  63.08 
 
 
413 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.32 
 
 
437 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  62.01 
 
 
437 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  63.08 
 
 
413 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.08 
 
 
413 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.91 
 
 
423 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.44 
 
 
421 aa  539  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  61.89 
 
 
414 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52.64 
 
 
417 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.44 
 
 
417 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  53.19 
 
 
420 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.09 
 
 
434 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.36 
 
 
434 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6857  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.01 
 
 
418 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.91 
 
 
410 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  45.81 
 
 
405 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.21 
 
 
414 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  45.81 
 
 
405 aa  359  5e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.61 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.72 
 
 
414 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.15 
 
 
412 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  44.36 
 
 
432 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  44.36 
 
 
410 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.5 
 
 
430 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.33 
 
 
423 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.42 
 
 
430 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  44.5 
 
 
445 aa  350  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  43.63 
 
 
429 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.01 
 
 
430 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1189  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.54 
 
 
450 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  43.14 
 
 
429 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.01 
 
 
430 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.01 
 
 
430 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  43.28 
 
 
430 aa  346  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.43 
 
 
424 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3219  Rieske (2Fe-2S) region  44.72 
 
 
408 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201195  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0981  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  45.02 
 
 
429 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40.83 
 
 
427 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.46 
 
 
412 aa  336  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  42.62 
 
 
410 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  40.33 
 
 
416 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.69 
 
 
414 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.76 
 
 
413 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.7 
 
 
418 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
423 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.02 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  31.27 
 
 
380 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  30.45 
 
 
374 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.97 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.24 
 
 
385 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  29.24 
 
 
385 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.24 
 
 
385 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  29.35 
 
 
376 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.25 
 
 
369 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.02 
 
 
373 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  28.03 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
423 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.65 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  36.45 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.47 
 
 
383 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  26.32 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.17 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.17 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.17 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
423 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  25.49 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  28.14 
 
 
393 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.21 
 
 
397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.64 
 
 
419 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  32.5 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  36.41 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  32.5 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  32.5 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.52 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4605  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0797  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.32 
 
 
419 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>