More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6857 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6857  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
418 aa  873    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.62 
 
 
417 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  57.99 
 
 
417 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.01 
 
 
419 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.01 
 
 
419 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.01 
 
 
419 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.52 
 
 
419 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.37 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50.25 
 
 
413 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  50.25 
 
 
413 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  50.25 
 
 
413 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50.25 
 
 
422 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50.49 
 
 
413 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50.25 
 
 
422 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50.25 
 
 
422 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50.25 
 
 
422 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50.25 
 
 
422 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.63 
 
 
413 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  49.63 
 
 
413 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  49.38 
 
 
413 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.13 
 
 
413 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.63 
 
 
413 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.38 
 
 
413 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.13 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.63 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  49.63 
 
 
437 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.26 
 
 
426 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  48.14 
 
 
414 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.54 
 
 
423 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.29 
 
 
421 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  45.7 
 
 
420 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.59 
 
 
412 aa  318  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.25 
 
 
434 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  40.19 
 
 
429 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  40.19 
 
 
429 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.22 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.97 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  41.03 
 
 
445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3219  Rieske (2Fe-2S) region  39.6 
 
 
408 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201195  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.04 
 
 
427 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  39.21 
 
 
416 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  37.83 
 
 
432 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.29 
 
 
430 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.8 
 
 
414 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  38.42 
 
 
410 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.77 
 
 
430 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.8 
 
 
430 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.05 
 
 
430 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.8 
 
 
430 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.05 
 
 
414 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1189  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.04 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.01 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  36.32 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.93 
 
 
412 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  36.16 
 
 
405 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0981  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  38.12 
 
 
429 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 
415 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  35.66 
 
 
405 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.91 
 
 
414 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  37.93 
 
 
410 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.38 
 
 
423 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 
418 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.57 
 
 
413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.5 
 
 
423 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.94 
 
 
408 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  30.02 
 
 
374 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  29.56 
 
 
380 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  28.82 
 
 
385 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.82 
 
 
385 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.8 
 
 
385 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.79 
 
 
403 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.41 
 
 
369 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 
373 aa  136  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  25.78 
 
 
396 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  35.03 
 
 
376 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  25.5 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.68 
 
 
383 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
374 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
374 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
374 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  32.41 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.88 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.23 
 
 
376 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.42 
 
 
377 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  31.37 
 
 
414 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.5 
 
 
384 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.06 
 
 
432 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2059  Rieske (2Fe-2S) region  30.91 
 
 
384 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.58 
 
 
418 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.612089  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.65 
 
 
423 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.16 
 
 
384 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
373 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 
385 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
456 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  33.17 
 
 
455 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
455 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  28.14 
 
 
374 aa  103  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1090  putative salicylate-5-hydroxylase large oxygenase component oxidoreductase protein  30.25 
 
 
418 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580229  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
455 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 
427 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>