More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0981 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  73.21 
 
 
414 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  75 
 
 
414 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.11 
 
 
414 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0981  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  100 
 
 
429 aa  906    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.63 
 
 
415 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  65.41 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  65.41 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3219  Rieske (2Fe-2S) region  57.76 
 
 
408 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201195  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.86 
 
 
412 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  54.7 
 
 
410 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.31 
 
 
412 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  52.39 
 
 
416 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1189  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.86 
 
 
450 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.39 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  50.37 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  49.25 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  50.37 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  49.14 
 
 
430 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.65 
 
 
430 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.74 
 
 
410 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.77 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  49.25 
 
 
410 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.53 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  49.15 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.03 
 
 
430 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  47.91 
 
 
422 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  47.91 
 
 
422 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  47.91 
 
 
422 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  48.02 
 
 
413 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  47.77 
 
 
413 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  47.67 
 
 
422 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  47.67 
 
 
422 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  47.27 
 
 
427 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  47.28 
 
 
413 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  45.52 
 
 
414 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.39 
 
 
426 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.01 
 
 
424 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.65 
 
 
423 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.17 
 
 
437 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  46.31 
 
 
413 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.42 
 
 
413 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.26 
 
 
413 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  45.28 
 
 
437 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  45.26 
 
 
413 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.26 
 
 
413 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.84 
 
 
421 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  44.77 
 
 
413 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.77 
 
 
413 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.77 
 
 
413 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.84 
 
 
419 aa  359  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.61 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.84 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.02 
 
 
419 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.58 
 
 
418 aa  345  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.88 
 
 
423 aa  342  7e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.17 
 
 
419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.46 
 
 
417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.79 
 
 
413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.5 
 
 
420 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43 
 
 
434 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.68 
 
 
434 aa  308  9e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.71 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6857  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.12 
 
 
418 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
423 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.16 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  32.22 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  28.93 
 
 
380 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.57 
 
 
385 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.13 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  30.41 
 
 
374 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  29.53 
 
 
385 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.53 
 
 
385 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.9 
 
 
369 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3894  ring hydroxylating dioxygenase, alpha- subunit  51.97 
 
 
141 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000000000760219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.07 
 
 
374 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.07 
 
 
374 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.07 
 
 
374 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.99 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  33.99 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  33.99 
 
 
374 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.99 
 
 
374 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  33.99 
 
 
374 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  33.99 
 
 
374 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.99 
 
 
374 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.99 
 
 
374 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  33.06 
 
 
387 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.7 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.7 
 
 
376 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  34.98 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.89 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  33.5 
 
 
427 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
421 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.79 
 
 
423 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
425 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.19 
 
 
430 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>