104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2619 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  47.37 
 
 
191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  42.25 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  38.92 
 
 
447 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  45 
 
 
447 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  39.31 
 
 
200 aa  115  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  38.41 
 
 
464 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  42.22 
 
 
213 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  38.82 
 
 
484 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  41.89 
 
 
188 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  35.91 
 
 
254 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  34.2 
 
 
191 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  38.13 
 
 
180 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  42.22 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  37.25 
 
 
481 aa  98.6  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  37.78 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  37.78 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  37.78 
 
 
199 aa  98.6  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  35.14 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  37.16 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  35.06 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  31.89 
 
 
197 aa  92  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  32.7 
 
 
184 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  29.83 
 
 
182 aa  88.2  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  30.98 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  36.62 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  33.33 
 
 
185 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  42.06 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  30.56 
 
 
522 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  31.25 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  32.46 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  32.98 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  30.41 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  29.33 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  34.38 
 
 
184 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  34.93 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  35.29 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  30.87 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  29.48 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  34.64 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  34.03 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  31.54 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  37.06 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  32.04 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  29.79 
 
 
468 aa  75.5  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  30.34 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  33.1 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  30.06 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  32.86 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  32.57 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  33.58 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  33.58 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  30.41 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  32.41 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  30.53 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  28.49 
 
 
438 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  31.47 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  31.51 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  33.56 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  31.17 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  30.34 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  29.65 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  36.5 
 
 
436 aa  68.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  30.16 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  29.28 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  29.66 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  30.73 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  32.37 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  32.61 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  27.57 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  29.09 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  27.96 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  28.48 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  29.45 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  29.45 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  32.17 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  29.86 
 
 
458 aa  65.5  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  28.8 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  32.58 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  26.95 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  29.41 
 
 
474 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  29.5 
 
 
467 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  29.22 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  29.38 
 
 
466 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  26.74 
 
 
438 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34758  predicted protein  39.25 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199149  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  24.73 
 
 
467 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03064  AMMECR1 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09390)  31.85 
 
 
343 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  30.15 
 
 
470 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  32.03 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  27.54 
 
 
459 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  27.21 
 
 
451 aa  55.1  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  27.68 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  27.52 
 
 
481 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  29.45 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0410  AMMECR1 domain protein  24.75 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03360  conserved hypothetical protein  30.72 
 
 
280 aa  49.3  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  25.29 
 
 
462 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27534  predicted protein  32.99 
 
 
210 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>