187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2152 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  983    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  44.1 
 
 
464 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  38.84 
 
 
484 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  36.3 
 
 
447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  36.08 
 
 
447 aa  272  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  31.66 
 
 
522 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  39.77 
 
 
265 aa  211  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  47.17 
 
 
274 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  46.56 
 
 
267 aa  202  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  44.83 
 
 
267 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  45.32 
 
 
274 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  42.18 
 
 
278 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  43.35 
 
 
282 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  43.56 
 
 
282 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  40.68 
 
 
268 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  43.4 
 
 
274 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  42.37 
 
 
268 aa  184  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  41.54 
 
 
274 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  37.02 
 
 
263 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  39.93 
 
 
270 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  42.19 
 
 
264 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  38.46 
 
 
254 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  41.42 
 
 
282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  34.57 
 
 
262 aa  167  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  46.51 
 
 
180 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  50.31 
 
 
180 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  39.7 
 
 
266 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  51.2 
 
 
202 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  50.67 
 
 
190 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  51.2 
 
 
202 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  29.57 
 
 
438 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  29.87 
 
 
438 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  29.65 
 
 
438 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  39.13 
 
 
268 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  36.96 
 
 
276 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  33.8 
 
 
287 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  35.56 
 
 
274 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  46.15 
 
 
197 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  35.34 
 
 
285 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  48.59 
 
 
194 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  33.45 
 
 
275 aa  137  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  44.38 
 
 
254 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  36.14 
 
 
287 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  48.3 
 
 
213 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  46.85 
 
 
202 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  34.69 
 
 
262 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  33.7 
 
 
262 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  45.45 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  32.62 
 
 
282 aa  127  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  34.32 
 
 
262 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  34.16 
 
 
269 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  46.43 
 
 
200 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  44.67 
 
 
202 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  32.6 
 
 
265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  29.37 
 
 
262 aa  122  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  35.66 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  33.45 
 
 
282 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  30.25 
 
 
282 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  32.51 
 
 
281 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  31.69 
 
 
281 aa  118  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  30.8 
 
 
284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  31.8 
 
 
281 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  30.51 
 
 
267 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  31.62 
 
 
283 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  29.67 
 
 
269 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  33.7 
 
 
267 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  31.45 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  34.69 
 
 
264 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  31.88 
 
 
277 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  28.92 
 
 
284 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  26.74 
 
 
267 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  29.21 
 
 
262 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  31.45 
 
 
277 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  32.96 
 
 
271 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  38.03 
 
 
191 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  33.33 
 
 
275 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  30.5 
 
 
284 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  30.14 
 
 
284 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  29.79 
 
 
284 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  34.32 
 
 
266 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  32.87 
 
 
298 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  32.58 
 
 
267 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  32.12 
 
 
264 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  34.74 
 
 
282 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  33.46 
 
 
265 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  36.11 
 
 
191 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  30.8 
 
 
284 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  35.23 
 
 
202 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  30.88 
 
 
268 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  27.27 
 
 
466 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  28.47 
 
 
284 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  31.88 
 
 
267 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  32.23 
 
 
279 aa  101  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  34.51 
 
 
203 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  32.12 
 
 
271 aa  99.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  37.25 
 
 
198 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  30.69 
 
 
267 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  33.33 
 
 
266 aa  97.8  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  40.3 
 
 
224 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  34.51 
 
 
199 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>