95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1928 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  95.11 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  61.8 
 
 
267 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  60.53 
 
 
267 aa  329  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  57.3 
 
 
267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  57.87 
 
 
267 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  56.3 
 
 
267 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  48.5 
 
 
267 aa  261  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  54.28 
 
 
265 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  45.11 
 
 
271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  43.12 
 
 
438 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  42.75 
 
 
438 aa  228  7e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  41.35 
 
 
438 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  41.44 
 
 
269 aa  222  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  43.66 
 
 
275 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  42.32 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  40.36 
 
 
281 aa  202  5e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  39.64 
 
 
281 aa  202  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  40.79 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  43.33 
 
 
282 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  42.7 
 
 
287 aa  199  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  52.16 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  40.38 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  39.93 
 
 
264 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  37.23 
 
 
284 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  38.15 
 
 
268 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  44.4 
 
 
329 aa  185  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  38.27 
 
 
282 aa  185  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  36.73 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  48.63 
 
 
265 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  36.82 
 
 
282 aa  177  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  37.45 
 
 
274 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  35.54 
 
 
284 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  48.24 
 
 
265 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  35.84 
 
 
284 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  35.54 
 
 
284 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  38.36 
 
 
298 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  35.71 
 
 
282 aa  171  7.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  34.27 
 
 
284 aa  171  9e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  36.6 
 
 
262 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  37.63 
 
 
277 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  37.37 
 
 
277 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  36.43 
 
 
271 aa  167  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  36.86 
 
 
275 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  37.87 
 
 
269 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  34.8 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  34.15 
 
 
284 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  38.58 
 
 
264 aa  152  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  37.31 
 
 
262 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  33.58 
 
 
262 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  34.96 
 
 
262 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  35.61 
 
 
283 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  33.96 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  31.62 
 
 
262 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  31.97 
 
 
522 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  32.58 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  33.93 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  32.09 
 
 
447 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  32.09 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  33.94 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  32.5 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  31.97 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  30.07 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  31.34 
 
 
284 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  30.48 
 
 
282 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  31.88 
 
 
464 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  30.34 
 
 
268 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  31.43 
 
 
274 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  31.37 
 
 
277 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  32.61 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  32.35 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  30.96 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  33.33 
 
 
481 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  30.88 
 
 
274 aa  95.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  31.12 
 
 
266 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  29.97 
 
 
270 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  28.31 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  32.74 
 
 
484 aa  92.8  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  29.12 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  28.36 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  26.2 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  35.64 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  30.4 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  27.9 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  25.98 
 
 
405 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 
346 aa  55.8  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  25.74 
 
 
405 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  28.17 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  27.01 
 
 
356 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  22.69 
 
 
345 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  27.71 
 
 
366 aa  48.9  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  29.5 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3387  protein of unknown function DUF52  30.65 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>