98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1003 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  48.19 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  44.67 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  39.38 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  38.59 
 
 		 202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  38.59 
 
 		 202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  42.96 
 
 		 464 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  38.03 
 
 		 481 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  34.5 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 484 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  39.71 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  34.92 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  33.71 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  34.2 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  32.42 
 
 		 254 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  31.52 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  30.65 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  34.73 
 
 		 202 aa  90.9  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  32.78 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  29.19 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  34.39 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  30.51 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  31.55 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  29.35 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  29.73 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  29.73 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  31.25 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  30.2 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  31.25 
 
 		 447 aa  78.2  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  30.14 
 
 		 447 aa  77.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  31.89 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  32.53 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  29.07 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  25.75 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  31.35 
 
 		 522 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  30.95 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  30.68 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  34.87 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  28.5 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  29.26 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  29.1 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  30.16 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  28.65 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  28.04 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  31.87 
 
 		 436 aa  68.2  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  32.21 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  32.21 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  27.42 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  32 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  29.03 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  28.34 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  32.05 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  26.23 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  27.46 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  24.61 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  29.23 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  28.8 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  32.28 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  28.02 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  29.61 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  23.96 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  32.06 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  30.43 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  25 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  30 
 
 		 481 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  32.64 
 
 		 470 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  25.99 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  25.95 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  25.79 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  25.37 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  25.37 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  28.49 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  26.37 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  28.07 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  25.97 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  27.97 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  26.92 
 
 		 468 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  29.19 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  25.93 
 
 		 451 aa  52  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  28.75 
 
 		 438 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  26.54 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  28.9 
 
 		 458 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  27.87 
 
 		 438 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  28.18 
 
 		 463 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  27.7 
 
 		 474 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  25.74 
 
 		 462 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2202  AMMECR1 domain protein  24.75 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.321257  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  25.5 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  26.11 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03360  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03064  AMMECR1 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09390)  34.48 
 
 		 343 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>