146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  977    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  51.42 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  39.8 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  39.84 
 
 		 462 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  36.98 
 
 		 466 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  37.84 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  39.67 
 
 		 459 aa  300  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  37.55 
 
 		 451 aa  292  7e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  36.31 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  36.7 
 
 		 468 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  34.15 
 
 		 467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  35.95 
 
 		 463 aa  272  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  34.23 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  34.63 
 
 		 436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  30.93 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01530  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  33.2 
 
 		 275 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02480  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  33.2 
 
 		 275 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  32.52 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  34.13 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  33.64 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  44.97 
 
 		 174 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  44.97 
 
 		 174 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  48.94 
 
 		 173 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  43.85 
 
 		 174 aa  136  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  44.19 
 
 		 172 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  40.96 
 
 		 172 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  39.13 
 
 		 174 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  39.13 
 
 		 174 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  29.32 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02500  hypothetical protein  44.53 
 
 		 141 aa  117  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.360289  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  44.27 
 
 		 180 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  35.94 
 
 		 189 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  30.56 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  42.86 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  37.82 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  42.24 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  29.56 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  37.5 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  40.35 
 
 		 208 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  31.97 
 
 		 185 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  34.84 
 
 		 202 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  35.58 
 
 		 182 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  35.8 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  40.43 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  36.13 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  39.5 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  32.65 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  36.69 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0840  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  27.4 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0449  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  28.02 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2712  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.2 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  36.54 
 
 		 187 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  32.72 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  41.82 
 
 		 184 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  42.06 
 
 		 184 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  34.16 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  32.64 
 
 		 180 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  34.82 
 
 		 183 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  35.11 
 
 		 180 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  32.73 
 
 		 200 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  34.38 
 
 		 208 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  37.06 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  37.14 
 
 		 183 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  42.99 
 
 		 184 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  32.54 
 
 		 190 aa  65.1  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  35.85 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  33.58 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  29.19 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  37.74 
 
 		 191 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  30.85 
 
 		 183 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  30.15 
 
 		 188 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  33.54 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  28.03 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  35.71 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  30.85 
 
 		 183 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  34.31 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  31.52 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  43.86 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  29.05 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  29.27 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  36.67 
 
 		 188 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  32.06 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  39.29 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  29.69 
 
 		 202 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  29.69 
 
 		 202 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  27.21 
 
 		 261 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04228  Homoprotocatechuate dyoxygenase  22.81 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04194  hypothetical protein  22.81 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  32.76 
 
 		 187 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4582  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.81 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3704  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.81 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  28.44 
 
 		 203 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4888  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.81 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  41.38 
 
 		 186 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  27.92 
 
 		 266 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34758  predicted protein  31.2 
 
 		 211 aa  55.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  42.42 
 
 		 191 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.134499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>