124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2680 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  851    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  43.9 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  38.74 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  39.4 
 
 
467 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  39.43 
 
 
466 aa  295  7e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  37.55 
 
 
467 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  41.12 
 
 
451 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  37.04 
 
 
468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  37.85 
 
 
463 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  37.87 
 
 
474 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  37.1 
 
 
470 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  35.08 
 
 
468 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  34.23 
 
 
481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  36.82 
 
 
436 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  34.41 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  48.19 
 
 
173 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  48.54 
 
 
174 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  48.54 
 
 
174 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  47.27 
 
 
174 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  46.34 
 
 
172 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01530  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.71 
 
 
275 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02480  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.71 
 
 
275 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  46.39 
 
 
172 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  46.39 
 
 
180 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  47.62 
 
 
174 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  47.62 
 
 
174 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  30.4 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  31.23 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  31.76 
 
 
438 aa  131  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  41.76 
 
 
438 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  34.15 
 
 
189 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  40.82 
 
 
522 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02500  hypothetical protein  37.69 
 
 
141 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.360289  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  32.2 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  36.52 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  37.12 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  41.36 
 
 
184 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  38.41 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  41.38 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  33.6 
 
 
179 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  28.96 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  30.06 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  40.74 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  31.11 
 
 
180 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1407  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  28.65 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  36.94 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  30.54 
 
 
183 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  39.1 
 
 
208 aa  69.7  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  40.46 
 
 
193 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  34.91 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  34.09 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  31.68 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  30.23 
 
 
183 aa  67  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  38.74 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  28.57 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0840  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.81 
 
 
279 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  36.43 
 
 
211 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  33.33 
 
 
202 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  33.33 
 
 
202 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  34.71 
 
 
194 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  31.52 
 
 
200 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  30.23 
 
 
183 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  32.7 
 
 
180 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  37.11 
 
 
184 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  32.86 
 
 
187 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  36.3 
 
 
183 aa  63.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  34.97 
 
 
196 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  37.5 
 
 
180 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  28.92 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  38.73 
 
 
213 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  37.96 
 
 
202 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  28.92 
 
 
447 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  31.54 
 
 
190 aa  61.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  32.52 
 
 
200 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  35.86 
 
 
188 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  27.88 
 
 
484 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  34.92 
 
 
233 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  33.11 
 
 
191 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  29.87 
 
 
199 aa  59.7  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1301  hypothetical protein  32.23 
 
 
205 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  32.06 
 
 
191 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  34.04 
 
 
220 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  34.93 
 
 
202 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  30.07 
 
 
203 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  32.65 
 
 
208 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  32.87 
 
 
203 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  36.27 
 
 
203 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  32.68 
 
 
202 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  31.68 
 
 
191 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  33.56 
 
 
224 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  32.21 
 
 
208 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3868  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  36.78 
 
 
283 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  37.61 
 
 
191 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03360  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 
280 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  30.5 
 
 
199 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1859  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  35.63 
 
 
283 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  33.09 
 
 
187 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  30.56 
 
 
213 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>