188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1094 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  91.55 
 
 
438 aa  832    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  895    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  89.73 
 
 
438 aa  823    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  44.87 
 
 
269 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  43.23 
 
 
267 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  42.01 
 
 
271 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  41.35 
 
 
266 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  40.98 
 
 
266 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  42.11 
 
 
267 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  44.44 
 
 
267 aa  216  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  40.98 
 
 
267 aa  216  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  42.24 
 
 
281 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  41.79 
 
 
264 aa  210  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  39.7 
 
 
267 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  36.02 
 
 
459 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  39.43 
 
 
281 aa  209  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  40.48 
 
 
267 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  39.11 
 
 
265 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  39.65 
 
 
284 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  38.95 
 
 
284 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  38.95 
 
 
284 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  36.49 
 
 
284 aa  199  9e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  44.4 
 
 
281 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  40.5 
 
 
282 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  38.03 
 
 
284 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  37.78 
 
 
298 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  38.04 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  40.07 
 
 
265 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  40.93 
 
 
271 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  38.2 
 
 
268 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  35.25 
 
 
275 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  34.78 
 
 
467 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  37.69 
 
 
262 aa  181  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  37.13 
 
 
269 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  34.1 
 
 
470 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  35.34 
 
 
451 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  35.96 
 
 
275 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  36.52 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  35.79 
 
 
262 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  36.18 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  35.58 
 
 
262 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  50.93 
 
 
174 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  50.93 
 
 
174 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  35.51 
 
 
274 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  28.94 
 
 
464 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  37.88 
 
 
282 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  53.01 
 
 
174 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  35.61 
 
 
284 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  35.85 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  32.32 
 
 
474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  32.6 
 
 
267 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  32.36 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  36.36 
 
 
463 aa  162  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  33.7 
 
 
282 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  34.8 
 
 
462 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  36.69 
 
 
283 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  33.21 
 
 
264 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  35.87 
 
 
277 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  29.65 
 
 
481 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  36.75 
 
 
329 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  28.84 
 
 
522 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  33.86 
 
 
466 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  36.17 
 
 
277 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  35.42 
 
 
262 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  49.71 
 
 
174 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  32.52 
 
 
481 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  49.71 
 
 
174 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  46.63 
 
 
468 aa  150  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  46.34 
 
 
180 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  28.1 
 
 
484 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  27.6 
 
 
447 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  46.67 
 
 
173 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  32.12 
 
 
262 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  46.78 
 
 
172 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  27.15 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  46.39 
 
 
172 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  35.45 
 
 
279 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  32.3 
 
 
298 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  32.84 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  35.38 
 
 
265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  31.76 
 
 
420 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  31.11 
 
 
276 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  36.72 
 
 
265 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  30.6 
 
 
277 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  36.72 
 
 
265 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  29.39 
 
 
284 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  32.26 
 
 
263 aa  113  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  32 
 
 
267 aa  108  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  29.2 
 
 
268 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  27.9 
 
 
282 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  33.33 
 
 
189 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  29.12 
 
 
278 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  29.2 
 
 
274 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  30.97 
 
 
254 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  27.42 
 
 
458 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  28.83 
 
 
268 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  25.96 
 
 
274 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  30.26 
 
 
282 aa  99.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  27.76 
 
 
265 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>