190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1586 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  917    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  40.65 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  40.43 
 
 		 447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  44.1 
 
 		 481 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  60.08 
 
 		 274 aa  293  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  58.94 
 
 		 267 aa  293  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  58.56 
 
 		 274 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  56.77 
 
 		 282 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  58.78 
 
 		 267 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  38 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  56.3 
 
 		 264 aa  266  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  47.78 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  55.94 
 
 		 274 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  48.33 
 
 		 270 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  46.01 
 
 		 268 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  52.09 
 
 		 274 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  52.71 
 
 		 282 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  37.84 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  58.08 
 
 		 213 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  47.55 
 
 		 266 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  45.14 
 
 		 282 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  46.36 
 
 		 268 aa  203  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  60.12 
 
 		 180 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  57.87 
 
 		 202 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  57.87 
 
 		 202 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  44.66 
 
 		 254 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  39.03 
 
 		 265 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  30.64 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  48.65 
 
 		 268 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  29.79 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  28.94 
 
 		 438 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  50.84 
 
 		 194 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  41.11 
 
 		 265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  36.26 
 
 		 263 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  53.37 
 
 		 188 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  38.41 
 
 		 271 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  46.93 
 
 		 254 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  35.58 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  35.16 
 
 		 276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  45.77 
 
 		 191 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  36.03 
 
 		 264 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  36.27 
 
 		 287 aa  140  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  43.56 
 
 		 200 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  45.14 
 
 		 180 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  32.95 
 
 		 262 aa  137  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  49.08 
 
 		 202 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  36 
 
 		 267 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  35.66 
 
 		 274 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  35.44 
 
 		 287 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  37.54 
 
 		 269 aa  133  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  36.67 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  37.32 
 
 		 267 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  43.11 
 
 		 197 aa  131  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  36.16 
 
 		 267 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  41.72 
 
 		 190 aa  127  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  42.96 
 
 		 191 aa  126  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  31.32 
 
 		 282 aa  126  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  29.48 
 
 		 267 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  34.6 
 
 		 284 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  32.23 
 
 		 262 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  38.49 
 
 		 267 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  34.96 
 
 		 267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  51.54 
 
 		 202 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  32.16 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  36.8 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  32.63 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  36.75 
 
 		 284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  29.35 
 
 		 275 aa  120  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  31.8 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  33.95 
 
 		 262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  32.61 
 
 		 282 aa  113  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  38.41 
 
 		 198 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  34.31 
 
 		 277 aa  113  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  32.97 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  34.55 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  30.38 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  32.26 
 
 		 269 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  31.69 
 
 		 285 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  32.97 
 
 		 277 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  39.35 
 
 		 282 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  35.9 
 
 		 203 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  33.33 
 
 		 271 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  30.88 
 
 		 284 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  32.61 
 
 		 266 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  33.09 
 
 		 279 aa  108  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  32.13 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  34.42 
 
 		 277 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  31.01 
 
 		 281 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  31.88 
 
 		 266 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  36.5 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  33.87 
 
 		 182 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  36.88 
 
 		 199 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  34.19 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  28.27 
 
 		 284 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  30.45 
 
 		 262 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  28.62 
 
 		 284 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  33.08 
 
 		 268 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 		 346 aa  100  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  34.81 
 
 		 270 aa  100  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  28.27 
 
 		 284 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>