93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1848 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  46.51 
 
 
263 aa  229  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  34.57 
 
 
481 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  35.36 
 
 
270 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  34.24 
 
 
267 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  35.34 
 
 
274 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  33.46 
 
 
267 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  34.93 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  40.62 
 
 
265 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  34.22 
 
 
274 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  32.83 
 
 
274 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  33.59 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  32.32 
 
 
282 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  32.95 
 
 
464 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  32.09 
 
 
268 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  31.87 
 
 
276 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  32.06 
 
 
447 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  31.68 
 
 
447 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  32.16 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  29.5 
 
 
282 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  31.56 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  31.75 
 
 
522 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  30.04 
 
 
484 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  30.51 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  31.01 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  31.09 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  32.58 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  30.19 
 
 
254 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  30.45 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  29.75 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  27.38 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  29.39 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  32.86 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  29.18 
 
 
287 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  28.88 
 
 
267 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  32.39 
 
 
277 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  31.21 
 
 
281 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  31 
 
 
271 aa  106  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  31 
 
 
274 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  29.41 
 
 
266 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  29.56 
 
 
275 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  28.27 
 
 
284 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  31.95 
 
 
262 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  32.74 
 
 
269 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  28.73 
 
 
267 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  27.31 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  30.37 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  28.42 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  28.27 
 
 
298 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  27.68 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  30.6 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  30.63 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  32.14 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  30.91 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  29.58 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  28.87 
 
 
282 aa  96.3  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  31.69 
 
 
284 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  31.45 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  29.78 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  28.83 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  28.31 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  30.63 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  26.41 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  30.6 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  29.51 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  26.84 
 
 
267 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  27.8 
 
 
281 aa  86.3  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  28.62 
 
 
438 aa  85.5  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  26.84 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  26.64 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  26.67 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  26.47 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  28.62 
 
 
438 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  25.27 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  28.98 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  82  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  28.51 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  28.29 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  28.74 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  28.46 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  28.36 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  28.74 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  30 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  31.21 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  26.81 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  33.96 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  30.16 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  25.7 
 
 
356 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2539  hypothetical protein  27.75 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  23.47 
 
 
301 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  22.96 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>