188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1313 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  893    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  91.55 
 
 
438 aa  832    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  90.64 
 
 
438 aa  822    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  44.11 
 
 
269 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  44.74 
 
 
267 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  43.61 
 
 
271 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  43.12 
 
 
266 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  42.48 
 
 
266 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  43.98 
 
 
267 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  42.86 
 
 
267 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  45.24 
 
 
267 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  41.88 
 
 
281 aa  217  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  41.42 
 
 
264 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  39.43 
 
 
281 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  41.27 
 
 
267 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  39.7 
 
 
267 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  36.64 
 
 
459 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  39.3 
 
 
284 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  38.01 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  35.79 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  38.6 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  38.95 
 
 
284 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  40.21 
 
 
282 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  44.4 
 
 
281 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  35.55 
 
 
468 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  39.18 
 
 
262 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  36.75 
 
 
284 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  41.54 
 
 
265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  36.67 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  38.52 
 
 
268 aa  189  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  36.7 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  37.87 
 
 
269 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  30.64 
 
 
464 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  34.01 
 
 
467 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  34.01 
 
 
470 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  38.08 
 
 
271 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  35.43 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  40.67 
 
 
282 aa  179  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  52.47 
 
 
174 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  52.47 
 
 
174 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  33.81 
 
 
275 aa  177  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  36.75 
 
 
287 aa  176  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  35.71 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  36.33 
 
 
262 aa  173  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  35.65 
 
 
463 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  34.91 
 
 
462 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  53.33 
 
 
174 aa  173  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  36.53 
 
 
262 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  34.41 
 
 
274 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  36.84 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  32.97 
 
 
267 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  32 
 
 
282 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  32.46 
 
 
474 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  38.36 
 
 
329 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  34.41 
 
 
466 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  34.17 
 
 
284 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  33.21 
 
 
264 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  47.06 
 
 
468 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  29.87 
 
 
481 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  35.84 
 
 
277 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  36.69 
 
 
283 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  48.17 
 
 
180 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  29.44 
 
 
484 aa  156  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  32.97 
 
 
282 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  47.09 
 
 
173 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  29.26 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  35.11 
 
 
277 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  51.18 
 
 
174 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  51.18 
 
 
174 aa  154  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  49.11 
 
 
172 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  33.58 
 
 
262 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  32.48 
 
 
262 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  47.02 
 
 
172 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  34.44 
 
 
279 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  27.83 
 
 
447 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  33.68 
 
 
298 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  33.64 
 
 
481 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  27.6 
 
 
447 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  32.08 
 
 
276 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  34.97 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  30.4 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  36.33 
 
 
265 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  37.5 
 
 
265 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  31.07 
 
 
284 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  37.5 
 
 
265 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  31.07 
 
 
277 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  31.02 
 
 
268 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  34.07 
 
 
267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  30.91 
 
 
263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  29.71 
 
 
274 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  29.56 
 
 
282 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  34.34 
 
 
189 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  30.97 
 
 
254 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  28.17 
 
 
278 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  31.16 
 
 
282 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  29.75 
 
 
266 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  30.11 
 
 
274 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  30.13 
 
 
264 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  28.83 
 
 
268 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  27.72 
 
 
274 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>