90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0469 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  45.48 
 
 		 282 aa  225  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  48.55 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  47.62 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  37.35 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  38.92 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  43.33 
 
 		 275 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  36.96 
 
 		 267 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  44.4 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  43.97 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  44.35 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  43.23 
 
 		 267 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  40.43 
 
 		 267 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  42.24 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  41.03 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  38.36 
 
 		 438 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  44.35 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  35.37 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  36.75 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  42.86 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  37.65 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 438 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  34.6 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  36.75 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  47.56 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  34.62 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  34.35 
 
 		 282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  33.88 
 
 		 274 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  34.8 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  35.4 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  31.4 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  32.4 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  26.97 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  50 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  32.4 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  27.58 
 
 		 284 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  33.88 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  27.58 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  48.2 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  36.17 
 
 		 269 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  33.2 
 
 		 264 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  35.04 
 
 		 265 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  27.64 
 
 		 275 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  32.4 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  33.19 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  26.75 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  31.91 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  31.31 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  33.89 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  32.47 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  27.64 
 
 		 522 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  33.47 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  30.54 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  34.89 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  32.91 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  31.28 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  32.9 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  30.3 
 
 		 447 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  27.95 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  28.33 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  30.3 
 
 		 447 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  27.02 
 
 		 484 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  34.89 
 
 		 464 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  28.13 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  34.47 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  34.62 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  32.78 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  35.06 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  28.51 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  27.81 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  28.92 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  30.74 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  31.27 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  27.52 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  26.94 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  27.64 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  33.88 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  30.17 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  29.88 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  29.71 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  29.71 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  28.51 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  32.22 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  29.65 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  27.8 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  25 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>