166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0269 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  946    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  52.79 
 
 
467 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  49.58 
 
 
470 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  51.84 
 
 
459 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  49.79 
 
 
451 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  44.28 
 
 
468 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  43.68 
 
 
462 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  41.72 
 
 
466 aa  359  7e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  42.37 
 
 
463 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  40.47 
 
 
474 aa  329  8e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  37.84 
 
 
481 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  39.4 
 
 
420 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  40 
 
 
468 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  36.64 
 
 
436 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  34.2 
 
 
458 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01530  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  40.96 
 
 
275 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02480  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  40.96 
 
 
275 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  50.89 
 
 
174 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  50.89 
 
 
174 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  34.01 
 
 
438 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  34.78 
 
 
438 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  51.19 
 
 
174 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  48.26 
 
 
180 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  46.78 
 
 
174 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  46.78 
 
 
174 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  33.46 
 
 
268 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  44.71 
 
 
172 aa  143  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  45.06 
 
 
173 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  43.37 
 
 
172 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  37.2 
 
 
189 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  30.91 
 
 
522 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0840  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  27.82 
 
 
279 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  38.1 
 
 
208 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  35.22 
 
 
205 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  36.6 
 
 
208 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  35.76 
 
 
208 aa  86.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  38.35 
 
 
193 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  34.44 
 
 
194 aa  84  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  32.12 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  36.09 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  35.81 
 
 
203 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  36.49 
 
 
180 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  35.14 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2767  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  31.88 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  31.94 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  41.67 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1407  hypothetical protein  28.3 
 
 
259 aa  79  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  32.48 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  33.33 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  31.72 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  37.84 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  36.36 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  29.55 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  32.62 
 
 
183 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  31.4 
 
 
180 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  36.88 
 
 
202 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  38.06 
 
 
211 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  32.21 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  34.44 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  38 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  33.83 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  36.76 
 
 
254 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  24.42 
 
 
481 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  31.07 
 
 
200 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  32.65 
 
 
213 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  37.1 
 
 
233 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  42.55 
 
 
184 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  30.87 
 
 
183 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  34.38 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  30.87 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  40.62 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  30.95 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  30.6 
 
 
202 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  33.1 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  30.6 
 
 
202 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  32.82 
 
 
180 aa  67  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  32.58 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  31.88 
 
 
203 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  30.71 
 
 
221 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  29.73 
 
 
187 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  41.49 
 
 
184 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  31.43 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  33.83 
 
 
188 aa  64.3  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  32.84 
 
 
187 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  26.09 
 
 
484 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  31.43 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  32.37 
 
 
220 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  33.72 
 
 
213 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  29.5 
 
 
198 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02500  hypothetical protein  27.94 
 
 
141 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.360289  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  33.33 
 
 
196 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  33.6 
 
 
202 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0449  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  26.42 
 
 
252 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  28.57 
 
 
219 aa  59.7  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  26.32 
 
 
464 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  33.76 
 
 
186 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  24.6 
 
 
203 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1167  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.06 
 
 
283 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>