106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2774 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  100 
 
 
233 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  58.79 
 
 
190 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  51 
 
 
183 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  51.52 
 
 
187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  49.49 
 
 
179 aa  180  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  41.62 
 
 
185 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  43.08 
 
 
180 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  43.3 
 
 
522 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  43.59 
 
 
179 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  42.35 
 
 
182 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  42.86 
 
 
181 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  42.35 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  45.05 
 
 
191 aa  144  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  41.84 
 
 
183 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  46.58 
 
 
183 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  45.92 
 
 
184 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  48.47 
 
 
184 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  47.96 
 
 
184 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  46.94 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  45.52 
 
 
187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  49.02 
 
 
187 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  43.87 
 
 
191 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  45.21 
 
 
198 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  39.64 
 
 
203 aa  118  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  45.34 
 
 
211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  44.03 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  40.45 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  39.74 
 
 
200 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  42.59 
 
 
213 aa  113  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  37.86 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  40.1 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  38.56 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  40.12 
 
 
219 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  40.24 
 
 
188 aa  108  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  38.1 
 
 
220 aa  108  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  45.16 
 
 
186 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  38.19 
 
 
191 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  38.56 
 
 
202 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  38.78 
 
 
196 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  40.65 
 
 
193 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  37.11 
 
 
199 aa  102  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  43.26 
 
 
191 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  36.73 
 
 
194 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  39.81 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  32.85 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  32.47 
 
 
484 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  32.21 
 
 
208 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  40.41 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  40.41 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  34.12 
 
 
191 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  33.01 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  31.4 
 
 
197 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  38.6 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  36.42 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  37.2 
 
 
464 aa  82  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  33.52 
 
 
174 aa  82  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  33.33 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  30.46 
 
 
174 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  30.46 
 
 
174 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  36.5 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  37.5 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  41.35 
 
 
470 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  30.2 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  34.59 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  37.58 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  32.04 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  37.5 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  37.5 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0410  AMMECR1 domain protein  32.5 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  35.29 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  37.89 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  25.87 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  34.97 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2470  AMMECR1 domain protein  30.5 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  36.84 
 
 
188 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  29.21 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  34.32 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  28.31 
 
 
468 aa  69.7  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2202  AMMECR1 domain protein  33.97 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.321257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  34.29 
 
 
462 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34758  predicted protein  31.65 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199149  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  34.46 
 
 
474 aa  68.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  33.14 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  37.1 
 
 
467 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  32.58 
 
 
172 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  33.33 
 
 
173 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  33.96 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  29.11 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  29.66 
 
 
447 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  37.6 
 
 
459 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  34.51 
 
 
463 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  33.58 
 
 
481 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  30.66 
 
 
447 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  32.41 
 
 
438 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  31.69 
 
 
438 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  34.92 
 
 
420 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  29.78 
 
 
467 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  39.37 
 
 
451 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  33.09 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27534  predicted protein  34.45 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>