78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27534 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_27534  predicted protein  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03360  conserved hypothetical protein  34.93 
 
 
280 aa  115  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34758  predicted protein  32.29 
 
 
211 aa  111  9e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199149  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03064  AMMECR1 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09390)  40.71 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  32.39 
 
 
522 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  38.05 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  32.59 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  36.94 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  36.28 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  33.91 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  37.27 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  35.51 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  34.23 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  33.04 
 
 
183 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  34.45 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  32.82 
 
 
459 aa  59.3  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  33.04 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  31.9 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  32.26 
 
 
187 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  31.71 
 
 
187 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  34.23 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  33.09 
 
 
464 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  31.09 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  33.81 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  30.94 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  32.14 
 
 
180 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  32.14 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  32.14 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  33.58 
 
 
200 aa  55.1  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  35.9 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  33.09 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  31.2 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  32.56 
 
 
481 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  30.58 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  34.82 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  29.75 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  30 
 
 
451 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  26.56 
 
 
481 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  34.82 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  34.82 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  31.86 
 
 
436 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  31.45 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  32.03 
 
 
193 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  28.68 
 
 
470 aa  49.3  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  35.24 
 
 
484 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  30.92 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  28.05 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  29.91 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  26.17 
 
 
190 aa  49.3  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  27.69 
 
 
467 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  36.49 
 
 
468 aa  48.5  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  33.33 
 
 
174 aa  48.5  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  31.93 
 
 
203 aa  48.5  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  35.09 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  34.75 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  35.82 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  33.78 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  30.38 
 
 
458 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  32.99 
 
 
198 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  28.7 
 
 
468 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  28.86 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  29.77 
 
 
467 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  32.03 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  29.27 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  30.61 
 
 
180 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  27.61 
 
 
172 aa  45.1  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  23.35 
 
 
447 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  29.37 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  34.91 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  23.36 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  23.36 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  30.77 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  28.79 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  22.35 
 
 
447 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  28.47 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  27.48 
 
 
438 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  32.14 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  27.43 
 
 
462 aa  41.6  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>