107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0462 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  56.67 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  49.49 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  48.09 
 
 		 190 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  50.85 
 
 		 522 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  49.15 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  48.07 
 
 		 187 aa  164  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  43.41 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  44.69 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  43.41 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  44.44 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  42.22 
 
 		 183 aa  154  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  42.78 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  48.28 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  44.25 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  45.76 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  41.48 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  40.22 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  42.62 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  42.47 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  45.1 
 
 		 220 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  48.65 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  41.95 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  46.1 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  38.3 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  42.54 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  41.25 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  43.18 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  41.88 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  45.2 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  43.43 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  41.83 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  38.6 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  44.63 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  40.98 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  34.95 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  45.45 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  41.55 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  44.52 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  39.58 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  36.56 
 
 		 208 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  43.75 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  33.16 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  35.8 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  39.07 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  36.27 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  37.42 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  37.97 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  37.97 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  31.05 
 
 		 484 aa  87.8  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  30.98 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  37.98 
 
 		 468 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  38.1 
 
 		 202 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  32.95 
 
 		 466 aa  85.5  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  36.77 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  35.57 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0410  AMMECR1 domain protein  33.97 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  37.14 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  35.57 
 
 		 481 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2202  AMMECR1 domain protein  31.76 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.321257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  33.55 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  39.13 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  39.13 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  33.1 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  33.1 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  35.1 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  31.89 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  33.81 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  37.5 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  29.05 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  34.13 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  36.72 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  28.49 
 
 		 447 aa  74.7  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  35.21 
 
 		 464 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  28.79 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  29.03 
 
 		 447 aa  74.7  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  37.67 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  34.03 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2470  AMMECR1 domain protein  30.13 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  35.29 
 
 		 463 aa  71.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  35.23 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  34.03 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  33.83 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  34.34 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  29.09 
 
 		 468 aa  69.3  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  34.09 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  32.89 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  37.86 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  30.11 
 
 		 438 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  34.06 
 
 		 436 aa  65.1  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  29.37 
 
 		 462 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03360  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  36.11 
 
 		 474 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  36.7 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  30.87 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  33.1 
 
 		 459 aa  62  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>