111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1250 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  100 
 
 
184 aa  359  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  97.83 
 
 
184 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  91.85 
 
 
184 aa  308  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  69.44 
 
 
184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  45.81 
 
 
183 aa  164  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  48.47 
 
 
233 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  43.58 
 
 
181 aa  144  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  43.18 
 
 
187 aa  141  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  38.12 
 
 
185 aa  141  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  39.78 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  48.45 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  49.42 
 
 
187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  42.13 
 
 
182 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  43.68 
 
 
208 aa  136  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  45.86 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  45.51 
 
 
522 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  50.68 
 
 
190 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  45.2 
 
 
179 aa  134  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  40.23 
 
 
180 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  41.9 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  40.78 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  46.2 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  44.67 
 
 
202 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  42.86 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  37.91 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  36.22 
 
 
208 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  39.78 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  33.52 
 
 
205 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  40.67 
 
 
191 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  41.78 
 
 
208 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  38.95 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  38.71 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  33.51 
 
 
203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  42.68 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  34.21 
 
 
203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  42.65 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  43.33 
 
 
186 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  38.07 
 
 
224 aa  111  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  38.78 
 
 
199 aa  110  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  39.05 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  37.88 
 
 
221 aa  108  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  37.02 
 
 
484 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  39.11 
 
 
196 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  37.24 
 
 
213 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  42.7 
 
 
194 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  41.5 
 
 
213 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  36.08 
 
 
220 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  36.31 
 
 
174 aa  98.6  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  36.31 
 
 
174 aa  98.6  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  35.35 
 
 
219 aa  97.4  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  36.46 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  38.46 
 
 
174 aa  94.7  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  38.46 
 
 
174 aa  94.7  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0410  AMMECR1 domain protein  36.96 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  39.06 
 
 
172 aa  92.8  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  33.85 
 
 
197 aa  92  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  39.87 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  41.89 
 
 
474 aa  91.7  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  37.34 
 
 
191 aa  90.9  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  36.75 
 
 
481 aa  87  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  38 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  34.64 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  34.69 
 
 
468 aa  85.1  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  42.61 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2202  AMMECR1 domain protein  34.78 
 
 
199 aa  84.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.321257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  36.23 
 
 
466 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  40.74 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2470  AMMECR1 domain protein  33.7 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  37.59 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  29.1 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  35.61 
 
 
438 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  38.75 
 
 
464 aa  78.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  34.55 
 
 
438 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  37.85 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  37.85 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  42.99 
 
 
481 aa  77.8  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  34.3 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  31.74 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  39.25 
 
 
462 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  30.53 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34758  predicted protein  35.04 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199149  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  37.14 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  31.36 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  37.5 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  33.12 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  37.5 
 
 
463 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  41.49 
 
 
467 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  37.88 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  38.69 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  35.33 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  38.46 
 
 
436 aa  72  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  43.43 
 
 
459 aa  71.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  37.08 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  27.55 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  30.56 
 
 
467 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  30.88 
 
 
447 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  36.65 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  34.34 
 
 
470 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  30.88 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  41.59 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>