102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0727 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  57.87 
 
 
464 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  52.07 
 
 
180 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  53.71 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  51.2 
 
 
481 aa  161  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  51.11 
 
 
188 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  45.21 
 
 
194 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  42.78 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  39.49 
 
 
200 aa  138  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  48.59 
 
 
180 aa  137  7.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  45.09 
 
 
202 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  38.76 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  42.16 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  38.59 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  42.78 
 
 
484 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  43.07 
 
 
447 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  42.34 
 
 
447 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  40 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  36.46 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  42.25 
 
 
202 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  31.69 
 
 
203 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  37.63 
 
 
181 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  34.39 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  37.78 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  34.43 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  37.59 
 
 
174 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  37.59 
 
 
174 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  34.59 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  37.5 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  36.81 
 
 
180 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  40.41 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  37.13 
 
 
190 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  31.25 
 
 
185 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  33.56 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  31.95 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  35.6 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  33.12 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  38.52 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  30.06 
 
 
174 aa  85.1  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  30.06 
 
 
174 aa  85.1  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  36.3 
 
 
522 aa  84.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  34 
 
 
173 aa  84.7  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  35.33 
 
 
436 aa  84.7  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  34.59 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  36.72 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  36.23 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  34.97 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  35.56 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  40.74 
 
 
183 aa  82  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  34.15 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  32.76 
 
 
470 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  31.18 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  32.26 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  30.77 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  30.3 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  28.99 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  28.74 
 
 
466 aa  79  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  39.13 
 
 
179 aa  79  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  29.52 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  34.29 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  37.7 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  33.69 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  32.2 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  37.76 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  31.64 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  34.97 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  29.95 
 
 
451 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  36.49 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  31.58 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  34.18 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  32.2 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  32.31 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  37.99 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  37.62 
 
 
459 aa  71.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  32.45 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  33.33 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  34.46 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  30.77 
 
 
474 aa  69.3  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  37.29 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  36.84 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  37.85 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  30.6 
 
 
467 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  32.65 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  32.67 
 
 
468 aa  66.2  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  33.33 
 
 
420 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  31.43 
 
 
438 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  30.07 
 
 
463 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  27.67 
 
 
467 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  30.6 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  28.17 
 
 
438 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  28.87 
 
 
438 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1174  AMMECR1 domain protein  33.82 
 
 
191 aa  58.2  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  29.69 
 
 
481 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  28.57 
 
 
462 aa  51.6  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  29.36 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03064  AMMECR1 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09390)  31.15 
 
 
343 aa  48.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34758  predicted protein  27.22 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>