118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1326 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  909    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  36.29 
 
 
470 aa  256  9e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  37.88 
 
 
459 aa  242  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  34.55 
 
 
467 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  34.2 
 
 
467 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  37.31 
 
 
451 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  31.49 
 
 
468 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  31.55 
 
 
466 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  33.12 
 
 
463 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  34.41 
 
 
420 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  30.95 
 
 
462 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  33.33 
 
 
436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  35.23 
 
 
474 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  30.93 
 
 
481 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  29.07 
 
 
468 aa  169  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01530  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.04 
 
 
275 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02480  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.04 
 
 
275 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  29.74 
 
 
268 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  27.42 
 
 
438 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  40.61 
 
 
174 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  40.61 
 
 
174 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  27.53 
 
 
438 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  28.29 
 
 
438 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  39.55 
 
 
172 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  43.07 
 
 
174 aa  97.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  43.07 
 
 
174 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  36.78 
 
 
174 aa  97.1  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  40.6 
 
 
173 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  36.03 
 
 
180 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  40.6 
 
 
172 aa  93.2  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  27.15 
 
 
522 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0840  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  27.56 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  36 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0449  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  30 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  32.43 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  39.07 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  33.33 
 
 
202 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  33.33 
 
 
202 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  38.1 
 
 
184 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  31.79 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  32.77 
 
 
181 aa  67  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02500  hypothetical protein  28.46 
 
 
141 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.360289  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  29.86 
 
 
198 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  34.09 
 
 
188 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  31.19 
 
 
191 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  35.37 
 
 
208 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  34.93 
 
 
203 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  32.95 
 
 
200 aa  63.9  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  29.41 
 
 
189 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  32.2 
 
 
208 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  34.67 
 
 
194 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3868  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  28.28 
 
 
283 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  29.8 
 
 
484 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  36 
 
 
203 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  35.81 
 
 
184 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  35.37 
 
 
191 aa  60.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1407  hypothetical protein  25.21 
 
 
259 aa  60.1  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  34.44 
 
 
200 aa  60.1  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  33.56 
 
 
464 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1145  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, beta subunit  26.35 
 
 
304 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  35.57 
 
 
184 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  33.15 
 
 
203 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  32.45 
 
 
193 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  32.14 
 
 
220 aa  58.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  30.11 
 
 
187 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  29.82 
 
 
182 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  36.05 
 
 
184 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2712  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  22.63 
 
 
259 aa  57.4  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  30.94 
 
 
202 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  29.58 
 
 
197 aa  57  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2767  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 
257 aa  56.6  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  29.44 
 
 
183 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  30.77 
 
 
187 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  31.96 
 
 
224 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  36.09 
 
 
187 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  34.97 
 
 
254 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  29.7 
 
 
213 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  30.69 
 
 
196 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  29.05 
 
 
183 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  29.45 
 
 
199 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  34.57 
 
 
219 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  30.87 
 
 
199 aa  54.3  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  32.41 
 
 
188 aa  54.3  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  32 
 
 
179 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  35.58 
 
 
190 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  29.61 
 
 
179 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  30.07 
 
 
213 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  31.12 
 
 
208 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  29.05 
 
 
183 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2292  AMMECR1 domain protein  29.38 
 
 
191 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  28.87 
 
 
185 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  34.66 
 
 
191 aa  51.2  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  30.47 
 
 
202 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  28.9 
 
 
191 aa  50.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03064  AMMECR1 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09390)  30.33 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  28.82 
 
 
180 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  28.9 
 
 
235 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  34.31 
 
 
183 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  33.06 
 
 
233 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27534  predicted protein  30.38 
 
 
210 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>