31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1129 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  57.94 
 
 
222 aa  208  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  46.74 
 
 
268 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  52.99 
 
 
238 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  44.28 
 
 
278 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  43.15 
 
 
236 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  42.56 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  43.62 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  40.17 
 
 
243 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  38.52 
 
 
266 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  37.55 
 
 
232 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  38.78 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  39.32 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  41.22 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  34.84 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  34.84 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  34.84 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  37.3 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  39.92 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  33.61 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  38.14 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  30.95 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  24.07 
 
 
467 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  21.48 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  36.75 
 
 
436 aa  48.9  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  29.63 
 
 
468 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  24.09 
 
 
463 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  36.28 
 
 
474 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  34.69 
 
 
470 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  30.63 
 
 
481 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1797  hypothetical protein  31.91 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>