77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01530 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01530  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02480  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  43.07 
 
 
467 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  44.83 
 
 
459 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  40.96 
 
 
468 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  41.04 
 
 
467 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  40 
 
 
470 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  37.45 
 
 
466 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  40.3 
 
 
451 aa  208  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  40.77 
 
 
463 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  39.77 
 
 
462 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  37.36 
 
 
268 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  34.69 
 
 
481 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  32.22 
 
 
474 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  36.98 
 
 
420 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  35.32 
 
 
458 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  34.94 
 
 
436 aa  156  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  31.47 
 
 
468 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0840  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.54 
 
 
279 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02500  hypothetical protein  29.93 
 
 
141 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.360289  normal  0.827686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2767  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1407  hypothetical protein  27.72 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0449  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  27.12 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2014  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.35 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.523696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1145  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, beta subunit  25.42 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3868  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  20.42 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1623  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  22.48 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1859  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.81 
 
 
283 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  25.17 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  23.49 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  26.22 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  27.44 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2712  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.53 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7572  protocatechuate 4,5-dioxygenase  32.35 
 
 
434 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3709  protocatechuate 4,5-dioxygenase  32.65 
 
 
430 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0521  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  26.15 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.43735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04228  Homoprotocatechuate dyoxygenase  21.79 
 
 
283 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04194  hypothetical protein  21.79 
 
 
283 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4582  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.79 
 
 
283 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4888  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.79 
 
 
283 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  27.71 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3704  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.79 
 
 
283 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6041  protocatechuate 4,5-dioxygenase  31.37 
 
 
434 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0923014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2174  protocatechuate 4,5-dioxygenase  31.31 
 
 
426 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3528  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  20.24 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0958832  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0103  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  26.21 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  25.2 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  27.39 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  27.27 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1198  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.79 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6377  protocatechuate 4,5-dioxygenase  32.65 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00210676  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2096  protocatechuate 4,5-dioxygenase  29.17 
 
 
420 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.624399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1213  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.4 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343521  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1167  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.4 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1062  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.4 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1178  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.4 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  25.95 
 
 
438 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0294  protocatechuate 4,5-dioxygenase subunit beta  23.72 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2458  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.4 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1137  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.48 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2267  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.48 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1732  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.92 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  25.61 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0103  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.48 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1026  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.48 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4035  3-(2,3-dihydroxyphenyl)propionate dioxygenase  23.83 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0941  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.48 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1510  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.48 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134122  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3858  3-(2,3-dihydroxyphenyl)propionate dioxygenase  22.04 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0874943  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3169  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  19.49 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3789  3-(2,3-dihydroxyphenyl)propionate dioxygenase  22.04 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  28.47 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0628  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.18 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39457  predicted protein  22.67 
 
 
388 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31250  protocatechuate 4,5-dioxygenase  29.59 
 
 
420 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2362  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  21.01 
 
 
285 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  23.81 
 
 
262 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>