90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0208 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  47.27 
 
 
298 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  49.62 
 
 
270 aa  251  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  50.55 
 
 
282 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  44.94 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  44.19 
 
 
275 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  40.3 
 
 
271 aa  202  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  41.04 
 
 
267 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  37.35 
 
 
329 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  38.52 
 
 
266 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  38.52 
 
 
438 aa  189  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  38.15 
 
 
266 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  42.22 
 
 
265 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  38.81 
 
 
267 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  39.03 
 
 
269 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  38.2 
 
 
438 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  37.08 
 
 
438 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  38.49 
 
 
267 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  39.31 
 
 
298 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  38.37 
 
 
267 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  39.53 
 
 
267 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  34.06 
 
 
281 aa  170  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  33.8 
 
 
284 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  33.8 
 
 
284 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  34.04 
 
 
284 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  35.42 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  32.6 
 
 
267 aa  163  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  32.97 
 
 
284 aa  163  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  32.97 
 
 
275 aa  162  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  33.09 
 
 
274 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  32.25 
 
 
281 aa  159  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  31.52 
 
 
281 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  31.27 
 
 
282 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  31.58 
 
 
265 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  32.96 
 
 
264 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  32.37 
 
 
282 aa  152  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  31.32 
 
 
284 aa  152  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  42.64 
 
 
265 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  32.16 
 
 
282 aa  151  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  32.27 
 
 
277 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  33.58 
 
 
262 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  30.63 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  32.38 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  34.53 
 
 
271 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  30.85 
 
 
277 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  32.58 
 
 
262 aa  142  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  42.25 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  30.88 
 
 
262 aa  136  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  41.86 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  32.58 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  31.42 
 
 
262 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  33.09 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  31.46 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  29.85 
 
 
522 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  29.92 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  34.56 
 
 
274 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  32.72 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  30.82 
 
 
270 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  34.56 
 
 
267 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  29.75 
 
 
262 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  34.31 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  26.84 
 
 
265 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  34.06 
 
 
282 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  30.6 
 
 
447 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  30.6 
 
 
447 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  33.83 
 
 
274 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  31.23 
 
 
268 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  29.06 
 
 
279 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  29.82 
 
 
282 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  30.88 
 
 
481 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  33.58 
 
 
264 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  33.08 
 
 
464 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  29.78 
 
 
254 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  29.86 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  30.71 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  29.79 
 
 
285 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  29.78 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  31.87 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  29.96 
 
 
484 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  32.38 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  31.06 
 
 
282 aa  85.5  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  27.41 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  30.69 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  27.53 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  30.51 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  28.93 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  25.09 
 
 
414 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  25.5 
 
 
405 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  22.77 
 
 
356 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  23.68 
 
 
346 aa  42  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>