92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0307 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  39.77 
 
 
481 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  41.2 
 
 
447 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  40.82 
 
 
447 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  39.03 
 
 
464 aa  195  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  36.5 
 
 
267 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  37.36 
 
 
268 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  36.53 
 
 
274 aa  185  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  37.36 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  36.98 
 
 
254 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  36.8 
 
 
268 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  36.33 
 
 
263 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  36.53 
 
 
274 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  35.38 
 
 
278 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  34.72 
 
 
274 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  35.32 
 
 
282 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  34.96 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  33.58 
 
 
267 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  36.26 
 
 
282 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  35.07 
 
 
266 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  34.48 
 
 
264 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  36.8 
 
 
262 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  33.71 
 
 
282 aa  148  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  40.62 
 
 
262 aa  145  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  32.27 
 
 
275 aa  142  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  35.29 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  33.69 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  31.23 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  33.21 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  37.15 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  33.94 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  30.8 
 
 
484 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  35.49 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  32.06 
 
 
282 aa  133  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  34.42 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  31.79 
 
 
522 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  32.97 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  31.87 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  34.8 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  33.1 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  34.16 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  36.03 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  35.13 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  32.18 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  32.36 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  35.89 
 
 
284 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  32.23 
 
 
262 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  34.88 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  29.18 
 
 
298 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  34.86 
 
 
269 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  32.28 
 
 
282 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  33.79 
 
 
281 aa  124  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  34.06 
 
 
274 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  34.77 
 
 
282 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  35.64 
 
 
284 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  30.63 
 
 
267 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  31.97 
 
 
265 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  35.8 
 
 
284 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  33.22 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  35.76 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  33.21 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  30.66 
 
 
281 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  28.93 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  30.36 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  29.29 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  29.96 
 
 
267 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  28.26 
 
 
275 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  33.94 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  30.07 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  30 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  27.62 
 
 
282 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  30.88 
 
 
279 aa  108  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  26.84 
 
 
268 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  31.75 
 
 
264 aa  102  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  27.94 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  27.76 
 
 
438 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  26.88 
 
 
438 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  28.31 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  27.76 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  27 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  28.33 
 
 
329 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  28.08 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
346 aa  86.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  27.69 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  28.11 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  23.91 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  27.06 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  25.48 
 
 
356 aa  72  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0526  dioxygenase-like protein  24.32 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.579832  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  27.69 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  23.53 
 
 
405 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>