11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1301 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1301  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1226  hypothetical protein  51.76 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  32.23 
 
 
420 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  25 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  25 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  23.86 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  26.38 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  28.04 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  26.76 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  26.24 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  31.4 
 
 
172 aa  42  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>