35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3517 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  494  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  58.62 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  47.12 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  44.01 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  44.66 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  47.37 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  38.52 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  41.31 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  41.89 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  38.35 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  40.15 
 
 		 236 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  36.78 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  35.74 
 
 		 232 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  34.35 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  42.05 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  38.49 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  28.62 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  34.25 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  31.48 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  28.07 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  28.07 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  26.85 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  25.26 
 
 		 467 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  28.24 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  23.99 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  40.8 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4155  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000191684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  29.03 
 
 		 436 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1556  hypothetical protein  52.05 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0182059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1797  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  24.49 
 
 		 467 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  24.56 
 
 		 463 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>