13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1797 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1797  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  35.71 
 
 
228 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  35.71 
 
 
228 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  35.71 
 
 
228 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  36.16 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  32.59 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  31.22 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  31.23 
 
 
260 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  33.78 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  32.16 
 
 
268 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  31.91 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>