29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2226 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  57.94 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  50.22 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  46.69 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  43.23 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  44.66 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  46.5 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  41.28 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  38.89 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  37.28 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  39.66 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  39.91 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  38.98 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  38.98 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  38.98 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  38.29 
 
 		 267 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  35.02 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  37.45 
 
 		 260 aa  85.1  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  37.2 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  41.05 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  36.44 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4155  hypothetical protein  46.81 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000191684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  32.93 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  24.72 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  22.46 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1797  hypothetical protein  34.22 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  23.74 
 
 		 468 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  24.16 
 
 		 467 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  32.99 
 
 		 470 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>