31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3909 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  435  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  40.78 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  42.44 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  38.49 
 
 		 278 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  38.14 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  46.09 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  41.99 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  40.16 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  38.3 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  42.42 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  34.85 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  34.25 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  39.15 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  28.94 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  28.94 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  28.94 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  37.5 
 
 		 436 aa  52.4  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  31.95 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  38.2 
 
 		 451 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  31.4 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  27.31 
 
 		 420 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  36.73 
 
 		 470 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  39.8 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  27.69 
 
 		 474 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  35.05 
 
 		 467 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  24.44 
 
 		 467 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  26.37 
 
 		 466 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  26.85 
 
 		 481 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  27.61 
 
 		 459 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>