30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1402 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  497  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  70.49 
 
 
278 aa  345  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  46.74 
 
 
235 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  51.15 
 
 
238 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  47.12 
 
 
266 aa  165  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  46.69 
 
 
222 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  46.13 
 
 
261 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  44.44 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  37.89 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  39.61 
 
 
243 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  41.42 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  37.88 
 
 
267 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  36.33 
 
 
236 aa  92.4  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  34.22 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  34.22 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  34.22 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  32.56 
 
 
231 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  28.67 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  31.3 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  30.74 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  41.57 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  35.27 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  28.52 
 
 
470 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  29.79 
 
 
459 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  31.13 
 
 
236 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  25 
 
 
467 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  23.38 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  23.74 
 
 
468 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  27.02 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1797  hypothetical protein  32.16 
 
 
206 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>