26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1444 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  70.49 
 
 
268 aa  345  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  52.06 
 
 
238 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  44.28 
 
 
235 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  43.23 
 
 
222 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  44.01 
 
 
266 aa  135  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  43.96 
 
 
261 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  37.22 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  37.88 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  43.82 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  42.37 
 
 
243 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  37.08 
 
 
267 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  33.82 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  33.82 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  33.82 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  36.1 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  25.83 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  31.99 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  31.72 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  38.49 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  29.85 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  22.41 
 
 
467 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  24.58 
 
 
470 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  25.68 
 
 
459 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>