33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1620 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  44.57 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  43.89 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  48.19 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  41.9 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  36.61 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  39.33 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  38.4 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  35.04 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  38.06 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  38.96 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  36.84 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  36.08 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  53.54 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  32.36 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  33.58 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  33.58 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  33.58 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  33.07 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  30.97 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  33.86 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  24.64 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  24.29 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  22.14 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  26.83 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  30.71 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  25.36 
 
 		 459 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4155  hypothetical protein  36.76 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000191684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  28.41 
 
 		 451 aa  45.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  24.39 
 
 		 481 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1797  hypothetical protein  31.85 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  22.68 
 
 		 463 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  20.5 
 
 		 466 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>